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Thèse de doctorat (2011-2014)
Ecole doctorale de l’Université de La Rochelle,
Formation d’origine :
Master AIEL (Approches Intégrées des Ecosystèmes Littoraux), 2009-2010

(2011-2014) Structuration écologique et démographie de la population de grands dauphins, Tursiops truncatus, du golfe normand-breton.

Mots clés : Génétique des populations, structure sociale, démographie, isotopes stables, conservation, grands dauphins

Directeur de thèse :
-  Christophe Guinet, Centre d’Etudes Biologiques de Chizé, UPR 1934
-  Benoit Simon-Bouhet, Université de La Rochelle, LIENSs UMR 7266
Financement : Bourse CIFRE avec le Groupe d’Etude des Cétacés du Cotentin


Structuration écologique et démographie de la population de grands dauphins, Tursiops truncatus, du golfe normand-breton
L’étude des paramètres démographiques et de la structure des populations de prédateurs supérieurs est essentielle pour comprendre leurs fonctionnements et prendre les mesures de conservation appropriées. Le golfe normand-breton abrite une importante population de grands dauphins sur laquelle il n’existe aucune connaissance. Un suivi de terrain est mené de façon régulière par le Groupe d’Etude des Cétacés du Cotentin depuis 2006. Dans cette zone, des enjeux contrastés se confrontent : la création d’un parc marin et le développement des activités éoliennes et hydroliennes offshores. Dans ce contexte, ma thèse a pour but de comprendre la structure à fine échelle de la population de grands dauphins à l’aide d’un panel d’outils : photo-identification, génétique et isotopes stables. Cette approche multi-traceurs permettra d’évaluer l’influence relative de l’utilisation de l’habitat, du sexe des individus et de leurs liens de parenté sur l’organisation sociale. Le deuxième objectif est d’évaluer l’état de santé de cette population en étudiant les paramètres démographiques à l’aide de deux approches : Capture-Marquage-Recapture (taille de la population, taux de survie) et génétique (taille efficace).

Par ailleurs, il est important, dans un objectif de conservation, de définir l’isolement génétique de la population. Cependant même si d’autres populations sédentaires fréquentent les eaux européennes, ainsi qu’une ou plusieurs populations « pélagiques », les liens génétiques et les mouvements entre ces différentes populations sont encore méconnus. Pour étudier la structure génétique de l’espèce en Atlantique Nord-Est, des collaborations ont été mises en place avec des laboratoires, instituts ou associations à travers l’Europe afin de récupérer des biopsies d’animaux vivants et des prélèvements d’animaux échoués.


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Principales collaborations :

  • Yves Cherel, Centre d’Etudes Biologiques de Chizé, UPR 1934
  • Christophe Barbraud, Centre d’Etudes Biologiques de Chizé, UPR 1934
  • Amélia Viricel, Université de La Rochelle, LIENSs UMR 7266
  • Florence Caurant, Université de La Rochelle, LIENSs UMR 7266
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Publications :

  • Louis M., Viricel A., Lucas T., Peltier H., Alfonsi E., Berrow S., Brownlow A., Covelo P., Dabin W., Deaville R., Gally F., Gauffier P., Penrose R., Silva M. A., Guinet C. and Simon-Bouhet B. 2014. Habitat-driven population structure of bottlenose dolphins, Tursiops truncatus, in the North-East Atlantic. Molecular Ecology, 23(4) : 857-874
  • Louis M., Guinet C., Lucas T., Viricel A., Peltier H., Alfonsi E., Berrow S., Brownlow A., Covelo P., Dabin W., Deaville R., Gally F., Gauffier P., Penrose R., Silva M. A. and Simon-Bouhet B. Population genetics of bottlenose dolphins in the North East Atlantic : a pelagic versus coastal segregation. Oral presentation, 27th Annual Conference of the European Cetacean Society, Setubal, Portugal, April 2013. Best student presentation award.
  • Louis M., Gally F., Barbraud C., Béesau J., Tixier P., Simon-Bouhet B., Le Rest K. and Guinet C. Social structure, abundance and conservation of a population of bottlenose dolphins, Tursiops truncatus, in the English Channel. Oral presentation, Workshop “Bottlenose dolphin’s conservation : what we can learn from different resident populations ? 27th Annual Conference of the European Cetacean Society, Setubal, Portugal, April 2013
  • Louis M., Béesau J., Gally F., Barbraud C. and Guinet C. Demography and social structure of a bottlenose dolphin population in the English Channel. Poster, 25th Annual Conference of the European Cetacean Society, Cadiz, Spain, March 2011