Plateformes/plateaux > Plateforme cytométrie-imagerie

Responsable : Laureen Beaugard

La plateforme de cytométrie-imagerie a été développée afin de permettre aux chercheurs de LIENSs (microbiologistes, biochimistes, toxicologistes et écologues) d’analyser virus, bactéries, phytoplancton, zooplancton et cellules animales.

Ces méthodes permettent de compter les cellules présentes dans un échantillon en les caractérisant individuellement selon leur taille, leur complexité ainsi que leur fluorescence naturelle (chlorophylle, phycoérythrine…) ou induite (marqueurs ADN…). Dans notre unité, ces méthodes sont par exemple utilisées pour suivre les variations, selon les saisons, des populations de microorganismes planctoniques.

Equipements principaux :

  • Cytomètre en flux : FACS CantoII : 3 lasers (BD Biosciences) : permet de dénombrer des particules de 3µm à 80µm.
JPEG - 53.6 ko
JPEG - 72.4 ko


  • Cytomètre en flux à imagerie : FlowCAM portable (Fluid Imaging) : permet de dénombrer et identifier des cellules planctoniques de 5µm à 3mm.
JPEG - 58.5 ko
JPEG - 86.2 ko

Equipements associées :

  • 2 PC
  • Logiciels associés :

- FACS CantoII : BD FACS Diva, FlowJo, ModFit

- FlowCAM : Visual Spreadsheet

Analyses réalisées :
- Dénombrement du pico-nanoplancton, des procaryotes et des virus dans divers écosystèmes aquatiques (mer, fleuve, marais)
- Dénombrement du pico-nanoplancton, des procaryotes et des virus dans le sédiment (sable, terre, vase)
- Identification et dénombrement des espèces planctoniques
- Etude des activités cellulaires de cellules animales
- Etude du cycle cellulaire de certaines algues

* La plateforme de cytométrie-imagerie n’inclut pas la chaine d’analyse d’image développée en écophysiologie.
Pour en savoir plus sur cette activité, visitez la page dédiée
ICI

Contacts :
Responsable technique : L. Beaugeard : laureen.beaugeard@univ-lr.fr :+33 (0)5 46 50 76 41
Responsable scientifique : H. Agogué : helene.agogue@univ-lr.fr :+33 (0)5 46 50 76 50

publie le jeudi 2 juin 2016