LIttoral ENvironnement et Sociétés (LIENSs) - UMR 7266

PHYTOBS : Réseau d'observation du phytoplancton

Thierry Guyot — 2021-08-31T14:50:44Z

Site web national du réseau d'observation : IR-ILICO

Site web national du réseau d'observation : CNRS-INSU

Le PHYTOBS :

Le réseau d'observation du phytoplancton (PHYTOBS) s'appuie sur un réseau de 26 sites des côtes Manche-Atlantique-Méditerranée effectuant à fréquence bimensuelle et sur le long terme des observations sur le phytoplancton marin et lagunaires dans leurs contextes hydrologiques afférents. Le SNO PHYTOBS est issu du REPHY (Réseau d'observation et de surveillance du phytoplancton et des phycotoxines) créé en 1984 par Ifremer et du SOMLIT (Service d'observation en milieu littoral) créé en 1995 par le CNRS.
Les suivis PHYTOBS reposent sur la stratégie définie par le SOMLIT : prélèvement d'eau en surface, à pleine mer (pour les sites soumis à la marée), tous les 15 jours. Sont adossés aux prélèvements phytoplanctoniques la mesure de 11 paramètres SOMLIT (température, salinité, oxygène dissous, nitrate, nitrite, ammonium, phosphate, silice dissoute, matière en suspension, chlorophylle a, matières en suspension). Les observations et analyses sont effectuées sous démarche qualité.

Les objectifs du PHYTOBS :

– analyser les réponses des communautés phytoplanctoniques aux changements environnementaux,
– évaluer la qualité du milieu littoral au travers d'indicateurs,
– définir les niches écologiques,
– détecter les variations de phénologie,
– et dans l'optique de services du SNO, accroitre la synergie de la communauté scientifique, le renforcement des compétences et la diffusion des connaissances.
Au niveau national, le SNO PHYTOBS est coordonné par Maud Lemoine (Ifremer Nantes) & Pascal Claquin (UMR BOREA, Université de Caen).

Le PHYTOBS à La Rochelle :

Le laboratoire LIENSs échantillonne pour le PHYTOBS depuis 2012 une station tous les 15 jours dans le pertuis d'Antioche où est positionnée la station SOMLIT :
– Les prélèvements sont réalisés à la bouteille Niskin à bord du navire « L'Estran » de La Rochelle Université.
– L'observation des échantillons fixés au lugol et le dénombrement du phytoplancton marin s'effectue au microscope inversé sur cuves à décantation.

Les acteurs du PHYTOBS au LIENSs

Responsable scientifique
Christine Dupuy, La Rochelle Université
Pierre-Guy Sauriau, CNRS (jusqu'en 2023)
Responsable technique SOMLIT
Philippe Pineau, CNRS
Responsable technique PHYTOBS
Claire Emery, CNRS
Pilote navire L'ESTRAN
Yves Brizard, La Rochelle Université
Responsable analyses taxinomiques
Beatrix Beker, Entreprise (depuis 2018)
Christophe Arnaud, CNRS (jusqu'en 2018)

Tous les clichés des espèces : © Arnaud C. / CNRS)

Mise à jour : novembre 2022

BenthOBS : Réseau d'observation de la macrofaune benthique

Thierry Guyot — 2021-08-30T16:51:13Z

Site web national du réseau d'observation : IR-ILICO

Le BenthOBS :

Le réseau d'observation de la macrofaune benthique (BenthOBS) a été créé en 2019. C'est un Service National d'Observation (SNO) « en incubation » qui fait partie de l'infrastructure de recherche littorale et côtière IR ILICO. Le BenthOBS constitue un réseau d'observation du macrozoobenthos associant les moyens humains, techniques et compétences de 12 partenaires issus des universités, du CNRS, de l'Ifremer et du MNHN. Dans un contexte de changement global impactant tous les océans, disposer de séries temporelles de moyen et long termes permet la mise en évidence des changements en cours des communautés benthiques et promeut leur compréhension, en particulier dans le domaine littoral. Ces changements s'opèrent en termes de diversité spécifique au sein des communautés et de fonctionnement des écosystèmes marins.

Les objectifs du BenthOBS :
– comprendre les trajectoires temporelles des communautés de la macrofaune benthique et caractériser leur dynamique fonctionnelle,
– comparer les données BenthOBS avec les données existantes sur le macrozoobenthos issues d'autres observatoires (BDD Benthos ILICO) et suivis spatio-temporels (DCE, DCSMM),
– coupler les données BenthOBS avec les données issues d'autres SNO décrivant la dynamique de la colonne d'eau (COAST-HF, SOMLIT) et des communautés pélagiques (SOMLIT, PHYTOBS),
– et plus généralement, dans un scénario d'érosion établie de la biodiversité terrestre, acquérir des connaissances naturalistes sur les espèces marines côtières de métropole, leur nombre, leur nature et leur dynamique.

Au niveau national, l'organisme de rattachement de BenthOBS est le Laboratoire d'Océanologie et de Géosciences UMR 8187 LOG, les coordinateurs nationaux en étant Vincent Bouchet (LOG, Université de Lille, Université Littoral Côte d'Opale, CNRS) et Nicolas Desroy (LER-CRESCO, Ifremer-MNHN).

Le BenthOBS à La Rochelle :

Le laboratoire LIENSs échantillonne trois stations deux fois par an au début du printemps (mars-avril) et en fin d'été (septembre-octobre) :
– Ces stations sont situées à Boyardville dans la baie de Marennes-Oléron, à la pointe d'Arcay dans le pertuis breton et dans le pertuis d'Antioche (Antioche / SOMLIT/PHYTOBS). Les données acquises concernent la richesse spécifique de la macrofaune benthique, la granulométrie, la teneur en matière organique des sédiments et la composition CHN des sédiments.
– Les prélèvements sont réalisés à la benne Van Veen ou Smith McIntyre à bord du navire « L'Estran » de La Rochelle Université.

Les acteurs du BenthOBS au LIENSs

Jérôme Jourde, IE CNRS : Responsable scientifique
Philippe Pineau, IE CNRS
Fabien Aubert, IE COHABYS ADERA
Pierre-Guy Sauriau, CR CNRS [Jusqu'au 31/12/2021]

Mise à jour : février 2021

OASU

Thierry Guyot — 2021-06-08T11:47:36Z

- OASU : Observatoire Aquitain des Sciences de L'univers

BIOSENA

Thierry Guyot — 2021-06-08T11:38:47Z

- BIOSENA : Réseau Régional de Recherche sur la Biodiversité et les Services Ecosystémiques

Autres réseaux

Thierry Guyot — 2021-06-08T10:30:56Z

Principaux réseaux de recherche internationaux

Arctox : A pan-arctic network to track mercury contamination across arctic marine food webs

ComMod : Companion Modelling

FB2NP : Franco-Brazilian network on Natural Products

GP2A : Group for the Promotion of Pharmaceutical chemistry in Academia

INCREASE : International Consortium on Eco-conception and Renewable Resources

Principaux réseaux de recherche nationaux

AllEnvi : Alliance nationale de recherche pour l'Environnement

APOLIMER : Anthropologie politique & Ecologie de la mer

CAI-RN : Compétences Archéométriques Interdisciplinaires -
Réseau National

GdR GE : Génomique Environnementale

GdR MAGIS : Méthodes et Applications pour la Géomatique et l'Information Spatiale

GDR MuFoPAM : MultiFonction des Peptides AntiMicrobiens

GIS ChemBioFrance : Chimiothèque nationale

GIS Etudes Touristiques

GIS Histoire et Sciences de la Mer

REVOSIMA : Réseau de surveillance volcanologique et sismologique de Mayotte

SCF : Société Chimique de France

Principaux réseaux de recherche régionaux

Acclima Terra : Comité Scientifique Régional
sur le Changement Climatique

BIOSENA : Biodiversité et Services écosystémiques
en Nouvelle Aquitaine

DIPEE : Dispositif de Partenariat en Écologie et Environnement

FREDD : Fédération de Recherche en Environnement
pour le Développement Durable

LRTZC : La Rochelle Territoire Zéro Carbone

ONCOSPHERE : Fédérer la recherche en cancérologie
en Nouvelle-Aquitaine

R3 Futurs-ACT : Anticipation du Changement Climatique
dans les Territoires en Transition

DYNALIT

Thierry Guyot — 2014-12-05T10:38:42Z

Site web du service d'observation

Voir en ligne : Site web du service d'observation

observatoires

Thierry Guyot — 2014-12-01T16:17:27Z

SONEL : Système d'Observation du Niveau des Eaux Littorales

ECOP : Évolution des CÔtes et des Pratiques

PELAGIS, système d'observation pour la conservation des mammifères et oiseaux marins

SOMLIT : Service d'Observation en Milieu LITtoral

Thierry Guyot — 2013-03-25T09:53:54Z

english version

Site web national du service d'observation

Le SOMLIT :

Le Service d'Observation en Milieu Littoral est un Service National d'Observation (SNO) labellisé par le CNRS-INSU depuis 1996. Il est depuis 2016 l'un des réseaux élémentaires de l'Infrastructure de Recherche Littorale et Côtière (IR-ILICO). Il mobilise de nos jours 10 stations et laboratoires marins français du littoral Manche-Atlantique-Méditerranée depuis Wimereux jusqu'à Marseille en passant par Brest. Toutes les équipes SOMLIT travaillent selon des protocoles communs normalisés. L'objectif du SOMLIT est l'observation à moyen et long terme de l'évolution de l'environnement marin pour comprendre, via l'étude de "séries multi-paramètres", la réponse des écosystèmes marins aux forçages naturels et aux contraintes anthropiques. L'observation SOMLIT concerne l'hydroclimat marin, la chimie, la biogéochimie et la biologie de la colonne d'eau.
Les protocoles communs imposent à tous :
– Un prélèvement en sub-surface à marée haute (± 1 h) avec une périodicité de 15 jours ;
– Un profil par sonde multiparamètre surface-fond ;
– Un corpus de 16 paramètres à analyser ;
– L'intégration d'une démarche qualité selon la norme NF/EN ISO/CCI 17025 ;
– Des exercices annuels d'inter-comparaison entre laboratoires CNRS et universitaires ainsi que la participation aux essais inter-laboratoires de l'Ifremer.
Le SOMLIT met à disposition des communautés nationales et internationales l'ensemble des résultats acquis via le site web national du SOMLIT.

Le SOMLIT à La Rochelle :

Le laboratoire LIENSs a intégré le réseau SOMLIT en 2012 après une phase initiale de mise en place opérée depuis juin 2011.
Le site est situé dans le Pertuis d'Antioche (entre les îles de Ré et d'Oléron) à 5 nautiques du port de Chef de Baie (La Rochelle) et pour une profondeur de 40 mètres (point bleu sut la carte). Ce site est situé en dehors des perturbations générées par les apports des petits fleuves (Lay, Sèvre et Charente) et est à l'écart des principales activités anthropiques (cultures marines, pêches côtières, dragages). Il reste sous influence océanique dominante même si son contexte hydrologique hivernal est influencé par les panaches de la Gironde et de la Loire. Le site est complémentaire des stations hydrologiques des réseaux préexistants REPHY et DCE (points jaune sur la carte) pour certaines placées à proximité des zones de cultures marines (ostréicoles et mytilicoles).
Les prélèvements sont réalisés à marée haute avec un coefficient de marée de 70 (± 10) avec le navire « L'ESTRAN » de l'Université de La Rochelle.

Les prélèvements d'eau de mer sont réalisés à la bouteille Niskin ; le profil surface-fond avec une sonde Seabird SBE 19plus multiparamètre et les prélèvements qualitatifs de phytoplancton au filet à phytoplancton (maille 10 µm).

L'eau de mer de la bouteille Niskin est ensuite transvasée en utilisant un flaconnage adapté à chaque paramètre (O2, pH, sels nutritifs, pico-nano plancton) et les fixateurs ad hoc ajoutés.

Organigramme :

Contacts :

Responsable scientifique : Hélène Agogué, Chargée de Recherche CNRS, tél : 05 46 50 76 50,
Email : helene.agogue@univ-lr.fr

Responsable qualité : Philippe Pineau, Ingénieur CNRS, tél : 05 46 50 76 60,
Email : philippe.pineau@univ-lr.fr

Mise à jour : janvier 2024

Voir en ligne : Site web du service d'observation

Liste des 16 variables mesurées par station

Thierry Guyot — 2013-03-25T09:53:47Z

Température (T) Unité : °C
Salinité (S) Unité : sans unité
Oxygène (O₂) : Unité : ml/l
Potentiel hydrogène (pH) : Unité : U
Ammonium (NH₄+) : Unité : µm/l
Nitrates (NO₃-) : Unité : µm/l
Nitrites (NO₂-) : Unité : µm/l
Phosphates (PO₄³-) : Unité : µm/l
Silicates (Si(OH)₄) : Unité : µm/l
Carbone Organique Particulaire (COP) : Unité : µg/l
Azote Organique Particulaire (NOP) : Unité : µg/l
Matières en Suspension (MES) : Unité : mg/l
Chlorophylle a (Chla) : Unité : µg/l
¹³C : Unité : ‰
¹⁵N : Unité : ‰
Pico-nanoplancton : Unité : comptage
Profil sonde CTD : température, conductivité, pression, fluorimétrie et turbidité

OBIONE : Observatoire Biodiversité Faune-Flore des Pertuis Charentais

Thierry Guyot — 2012-09-18T13:07:42Z

L'Observatoire de la Biodiversité Faune-Flore des Pertuis charentais (OBIONE) a pour objectif de réaliser un bilan de la biodiversité des invertébrés benthiques et des macroalgues à l'échelle géographique des Pertuis charentais et de contribuer à observer leurs évolutions.

OBIONE s'appuie sur un bilan réactualisé dans les années 2000 des connaissances sur la faune des invertébrés et la flore des macroalgues marines des Pertuis charentais, et plus largement sur les habitats littoraux, côtiers et estuariens de la Mer des Pertuis charentais. Les observations du LIENSs sont réalisées en collaboration avec :

Le réseau BenthOBS ou réseau d'observation de la macrofaune benthique inclus dans l'infrastructure de recherche littorale et côtière (ILICO). Le BenthOBS a en charge d'établir d'une part des inventaires faunistiques à proximités des stations marines et, d'autre part, une base de données recensant l'ensemble des données de la macrofaune benthique de la façade maritime française, principalement métropolitaine, en vue de son exploitation scientifique ;
Le réseau d'observation « Littoral, limicoles et macrofaune benthique » des Réserves Naturelles de France RNF ;
L'Office français de la biodiversité OFB à travers le projet CARTHAM de 2012 de cartographie des habitats marins littoraux et côtiers qui a permis grâce à des stratégies coordonnées d'acquisition de connaissances (sonar, satellite, vérité terrain, prélèvements ponctuels) de cartographier les habitats marins selon une typologie commune à l'échelle européenne (EUNIS).

Les activités d'observation se traduisent par :

La réalisation de suivis DCE/DCSMM sur trois indicateurs de la qualité écologique que sont les invertébrés de substrats meubles, les herbiers de Zostera noltei et les macroalgues de substrat rocheux et meubles intertidaux. Les stations de surveillance sont localisées dans le Pertuis breton, le Pertuis d'Antioche, la baie de Marennes-Oléron et les estuaires du Lay, Charente, Seudre et Gironde. Ces suivis sont coordonnés à l'échelle nationale par ifremer et le MNHN Concarneau. Ils se font en collaboration avec Cohabys de La Rochelle pour les indicateurs "faune des invertébrés et herbier" et avec l'association OBIOS-Objectifs Biodiversités de Pont-l'Abbé-d'Arnoult pour l'indicateur "macroalgues intertidales".
La mise en place d'un suivi à long terme de la macrofaune benthique sur une station de référence située dans le Pertuis d'Antioche à l'écart des influences estuariennes et anthropiques. Il est mené en parallèle d'un suivi des paramètres physico-chimiques et phytoplanctoniques de la colonne d'eau coordonné à l'échelle Manche-Atlantique dans le cadre du Service d'Observation en Milieu Littoral SOMLIT et du Réseau d'observation du phytoplancton PHYTOBS.
La réalisation d'un suivi annuel des habitats benthique des quatre réserves naturelles des Pertuis Charentais : Baie de l'Aiguillon, Lilleau des Niges, Yves et Moëze-Oléron (Collaboration OBIONE/RNF/LPO/ONCFS).
La détection et la prise en compte d'informations nouvelles concernant des espèces (faune et flore) non encore observées dans les Pertuis Charentais, en particulier les espèces introduites et parfois invasives. Ces informations proviennent des suivis, des travaux de thèse, des projets de recherche, des collaborations réalisées dans le laboratoire LIENSs ainsi que des signalisations émanant d'usagers du domaine public maritime.

Les sites DCE/DCSMM sont distribués comme suit :

En eaux côtières :
- Pour les macroalgues, un site sur l'île de Ré au Grouin et un site sur l'île d'Oléron au Sabia.
  - Un survol drone au Sabia a permis au printemps 2021 de noter, en comparaison du suivi antérieur de 2018, la disparition de la ceinture d'Ascophyllum nodosum - Fucus vesiculosus d'une grande partie du médiolittoral moyen..
  - Un survol drone au Grouin a permis à l'automne 2021 d'établir une cartographie des habitats selon la typologie EUNIS et de caractériser l'évolution temporelle de la richesse spécifique des ceintures algales pour la période 2007-2019.
- Pour les invertébrés, trois site dans le Pertuis breton et trois sites dans le Pertuis d'Antioche et baie de Marennes-Oléron.
- Pour les herbiers de Zostera noltei, deux sites sur l'île de Ré, trois sites sur l'île d'Oléron et un site à Bonne Anse dans l'estuaire de la Gironde.
  
  Carte de localisation des sites d'observation sur herbier (cliquer pour agrandir)
  
  Sauriau P.-G.
En eaux de transition :
- Pour les macroalgues, un site rocheux et un site sur vase dans chacun des estuaires de la Charente et de la Gironde.
- Pour les invertébrés, trois sites dans l'Anse de l'Aiguillon, cinq sites dans l'estuaire de la Charente et trois sites dans l'estuaire de la Seudre.

Publications

Hummel H., Van Avesaath P., Wijnhoven S., Kleine-Schaars L., Degraer S., Kerckhof F., Bojanic N., Skejic S., Vidjak O., Rousou M., Orav-Kotta H., Kotta J., Jourde J., Pedrotti M.L., Leclerc J.-C., Simon N., Rigaut-Jalabert F., Bachelet G., Lavesque N., Arvanitidis C., Pavloudi C., Faulwetter S., Crowe T., Coughlan J., Benedetti-Cecchi L., Dal Bello M., Magni P., Como S., Coppa S., Ikauniece A., Ruginis T., Jankowska E., Weslawski J.M., Warzocha J., Gromisz S., Witalis B., Silva T., Ribeiro P., Fernandes De Matos V.K., Sousa-Pinto I., Veiga P., Troncoso J., Guinda X., Juanes De La Pena J.A., Puente A., Espinosa F., Pérez-Ruzafa A., Frost M., Mcneill C.L., Peleg O., Rilov G., 2016. ‘Geographic patterns of biodiversity in European coastal marine benthos', Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom, , pp. 1–17. doi : 10.1017/S0025315416001119.
Le Garrec, V., Grall, J., Chevalier, C., Guyonnet, B., Jourde, J., Lavesque, N., Bonifácio, P. and Blake, J.A., 2016. ‘Chaetozone corona (Polychaeta, Cirratulidae) in the Bay of Biscay : a new alien species for the North-east Atlantic waters ?', Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom, , pp. 1–13. doi : 10.1017/S0025315416000540.
Spilmont N., Hachet A., Faasse M.A., Jourde J., Luczak C., Seuront L., Rolet C., 2016. First records of Ptilohyale littoralis (Amphipoda : Hyalidae) and Boccardia proboscidea (Polychaeta : Spionidae) from the coast of the English Channel : habitat use and coexistence with other species. Marine Biodiversity 1–11. doi:10.1007/s12526-016-0557-3
Drumm D.T., Jourde J., Bocher P., 2015. A new species of the genus Monokalliapseudes (Crustacea : Tanaidacea : Kalliapseudidae) from French Guiana. Proceedings of the Biological Society of Washington 128, 86–97. doi:10.2988/0006-324X-128.1.86
Jourde J., Sampaio L., Barnich R., Bonifácio P., Labrune C., Quintino V., Sauriau P.-G., 2014. ‘Malmgrenia louiseae sp. nov., a new scale worm species (Polychaeta : Polynoidae) from southern Europe with a key to European Malmgrenia species', Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom, 95(5), pp. 947–952. doi : 10.1017/S0025315414001878
Jourde J., Sauriau P.-G., Guenneteau S., Caillot E., 2013. First record of Grandidierella japonica Stephensen, 1938 (Amphipoda : Aoridae) from mainland Europe. BioInvasion Records 2(1) : 51-55 (open access)
Sauriau P.-G., Curti C., Jourde J., Aubert F., Cajeri P., Lavesque N., Dubois S., Lepareur F., Gouesbier C., Sauriau F., Sauriau M., Latry L., Leguay D., Robert S., Pineau P., Geairon P., 2012. Le maerl algues corallinacées marines dans les Pertuis Charentais. Annales de la Société de Sciences Naturelles de Charente-Maritime 10(3) : 281-300

Travaux associés

présentation du projet EMBOS

OBIONE en bref :

Date de création : 01/01/2012
Coordonnées : 2 rue Olympe de Gouges, 17000 La Rochelle

Responsables :
– Pierre-Guy Sauriau, Chargé de Recherche CNRS
– Jérôme Jourde, Ingénieur d'Étude CNRS

Objectif :
Suivi de la biodiversité des invertébrés et macroalgues marines dans la Mer des Pertuis charentais

Compétences :
– Analyse faunistique d'échantillons d'invertébrés marins
– Expertise écologique du bon état écologique

Contact
Sauriau P.-G. - Jourde J.
Email : pierre-guy.sauriau*at*univ-lr.fr
Email : jerome.jourde*at*univ-lr.fr