Microbiologie, cultures et incubations

Thierry Guyot — 2008-06-26T13:53:22Z

Equipe référente :

Chercheurs :

S. Sablé - Microbiologie Bâtiment ILE2
L. Picot - Culture Cellulaire Bâtiment ILE2

Techniciens :

Equipements

Equipement principaux :

– ILE , algologie

Enceintes thermostatées
pH mètre de paillasse
chauffe ballon pour milieu gélosé
microscope droit Novex

– ILE, culture cellulaire

PSM
Incubateur CO2

– Curie, culture cellulaire

2 PSM
1 Microscope avec appareil photo et fluorescence
étuve CO2
frigo/congélo -20°C/congélo -80°C/azote liquide
Centrifugeuse cellules
Bains marie
Lecteur microplaques 96 puits
Centrifugeuse microplaques
2 robots Pipeteur diluteurs type Eppendorf Epmotion
Balance de précision

– ILE, microbiologie

2 PSM
Centrifugeuse Jouan (x 4500 rpm, max)
Incubateur agitant thermostaté réfrigérant
Sonicateur (sonde)
Loupe binoculaire
Microscope inversé Nikon (x 10, 20 et 40)
Poste filtration fluorochrome DAPI (rampe 3 colonnes) avec pompe
Poste filtration fluorochrome Sybr–green (une colonne) pompe manuelle
Table agitation
Bain–marie (2 bacs) non agité
Microcentrifugeuse Jouan (x 15 000 rpm)
pH mètre portatif
Incubateur (diversité)
1 pompe Millipore (pour diversité)

– Curie, microbiologie

Autoclave Varioklav
4 PSM type II
2 Congélateurs –80°C Thermo Electron et 2 congélateurs -20°C
1 Speed vack Maxi Dry Plus Heto
2 Bain–marie à agitation orbital Aquatron Infors
1 étuve réfrigérante à agitation orbital Ecotron Infors
1 Bain-marie Grant OLS 200
1 bain-marie 100°C Memmert
1 centrifugeuse SIGMA 3-18K
1 spectrophotomètre
1 appareil à eau distillée autostill4000x Jencons
1 pHmètre Knick
1 microonde
1 distributeur de milieu liquide
1 enceinte d'anaérobiose DW Scientific associé avec mélange de gaz cristal 10% hydrogène, 90% d'azote
1 microscope à épifluorescence Leica DMRB équipée d'une caméra
1 spectrofluorimètre
Lecteur microplaques à fluorescence-bioluminescence-polarisation de fluorescence (BMG Optima)

– ILE , ultracentrifugeuse

Ultracentrifugeuse Beckmann

– ILE , chambre froide 4°C

Agitateurs rotatifs pour extraction Chla|

– ILE, salle climatisée 18 °C

Congélateur – 80 °C
Congélateur armoire – 20°C (eau et vase)
Congélateur coffre- 20°C (divers)
Congélateur armoire -20°C (toxicologie)
Congélateur bas -20°C (lames microscopie, fluorochrome)
Réfrigérateur milieu culture avec agitateur rotatif
Réfrigérateur de sécurité

– ILE, salle thermostatée

– ILE, salle filtration

1 trépied de filtration Sartorius avec pompe péristaltique
1 trépied de filtration Millipore avec pompe péristaltique
1 système d'ultrafiltration Sartorius avec pompe
1 rampe (3 colonnes 47 mm)
1 rampe (3 colonnes 25 mm)
3 pompes Millipore

Matériel associé général :}

microPipettes , pipetteaid, bloc thermostaté (12 microtubes)
Bidons (7 de 7L opaques)
Bidons réservés ultrafiltration
Bidons réservés algothèque
Eprouvettes etc ...

Mesures réalisées

Ce plateau technique est composé de plusieurs unités dont les équipements permettent l'isolement, l'incubation et la mise en culture de micro-organismes du milieu marin tels que le microphytoplancton, les Protistes hétérotrophes, les Bactéries et les Virus ainsi que des cultures cellulaires d'organismes métazoaires marins. Dans la salle de filtration sont filtrés les échantillons de MES, nutriments organiques et minéraux et chlorophylle.

Fonctionnement du plateau

Compétences : L'équipe référente assure la mise en œuvre, la gestion, la maintenance et la jouvence des équipements.
La préparation des échantillons est assurée par les utilisateurs. Les chercheurs demandeurs d'analyses sont responsables des protocoles de préparation, ainsi que du bon entretien des équipements annexes (balances ..) utilisés par eux-mêmes ou par leurs doctorants et stagiaires.

Accessibilité : Sous réserve de contraintes techniques et de disponibilité du personnel habilité.
Seul le personnel habilité après formation par l'équipe référente peut utiliser l'ultracentrifugeuse, les réglages et la maintenance étant exclusivement du ressort des référents.
La salle « d'algothèque » est confinée ainsi que les salles « virologie » et « culture cellulaire ». La salle de filtration du rez de chaussée est réservée pour des travaux sur le vivant (la sorbonne ne doit pas être utilisée pour des produits chimiques).
Le planning de réservation de la salle thermostatée est géré par l'équipe référente en accord avec les priorités scientifiques.

Contraintes :
Les réfrigérateurs et congélateurs doivent être surveillés par les propriétaires d'échantillons : un descriptif du contenu de chaque appareil sera affiché sur la porte et devra être correctement réactualisé.

Traçabilité :
tenue obligatoire d'un cahier pour chaque centrifugeuse, d'un cahier pour le repiquage des algues, d'un cahier de laboratoire pour les filtrations MES, Chla etc.

Coût d'analyse :
Financement par le plateau :

Financement algothèque :

Financement filtration MES, Chl a : filtres GFF,

Préparation eau de mer filtrée 0,2 µm : membranes 0,2 µm pour trépied

Coût des consommables (tubes, membranes, etc) prélevé sur crédits équipe ou contrats
Contrats centrifugeuse Jouan et Beckmann
Contrat PSM Jouan