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Thèse de doctorat 2014/2017
Ecole doctorale Gay Lussac de l’Université de La Rochelle
Formation d’origine :
Master Pro/Recherche BIOTECHNOLOGIE - BMB (Biomolécules, Microorganismes, Bioprocédés), UBS, LORIENT

(2014-2017) Etude d’un modèle exceptionnel issu de la biodiversité littorale de Charente-Maritime : la bactérie iridescente Cellulophaga lytica.

Mots clés : Cellulophaga lytica, iridescence, bactérie marine, bacteroidetes, gliding, génétique, éco-biologie, mécanismes (inter)cellulaires, nanostructure, processus biochimiques, physiologie microbienne, bioénergétique, biofilm

Directeur de thèse :
Eric ROSENFELD, MCF-HDR, Université de La Rochelle, LIENSs UMR 7266
Isabelle GOUBET, MCF, Université de La Rochelle, LIENSs UMR 7266
Financement : Financement Région Poitou-Charentes



Etude d’un modèle exceptionnel issu de la biodiversité littorale de Charente-Maritime : la bactérie iridescente Cellulophaga lytica.
L’iridescence est un mode de coloration original rencontré chez certains animaux terrestres (oiseaux, papillons) et organismes marins (poissons, crabes, diatomées) et a été très peu étudiée dans le monde procaryote. En 2010, nous avons isolé une bactérie marine remarquable (Cellulophaga lytica) dont les colonies présentent une iridescence intense en « paillettes » sous éclairage naturel direct. Suite à cette découverte, nous avons notamment montré que l’iridescence est causée par un quasi-ordre de la population de cellules au sein du biofilm. Un tel niveau d’organisation ainsi que les mécanismes moléculaires et biochimiques impliqués dans la formation des structures multicellulaires iridescentes restent inconnus. Nous les étudierons en faisant intervenir différentes équipes dont les compétences sont reconnues. Le projet se situera à l’interface de l’écologie microbiennes alliant biologie moléculaire et physiologie bactérienne, de la génomique, de la physique, des bio-nanosciences et de l’analyse d’image.




Principales collaborations :
  • Tam Mignot (DR2), Laboratoire de chimie bactérienne (Marseille), UMR 7283
  • Jean-François Bernardet (IR) et Eric Duchaud (DR), INRA (Jouy en josas)
  • Renaud Péteri (MCF), MIA (La Rochelle)
  • Peter Vukusic (Professor), School of Physics (University of Exeter, UK)
  • Leon Espinosa (IR), Laboratoire de chimie bactérienne (Marseille), UMR 7283
  • Dimitri Deheyn, Scripss Institution of Oceanography, (UC San Diego, USA

Activités d’enseignement :

  • Monitorat à l’Université de La Rochelle au sein du département de Biotechnologie