Annuaire > Viricel-Pante Amélia

Enseignant-chercheur contractuelle
Post-doctorat 2016
ATER 2013/2015
Post-doctorat 2012/2013
Ph.D. 2006/2012
Environmental and Evolutionary Biology, University of Louisiana at Lafayette (USA) (Dir. Patricia Rosel)
Formation d’origine :
Master of Science en biologie marine, College of Charleston, South-Carolina (USA), 2003-2006
Bachelor of Science en biologie marine, College of Charleston, South-Carolina (USA), 2001-2002

Mots clés : Génétique et génomique des populations, transcriptomique, biologie de la conservation

Etude des processus évolutifs en milieu marin.
La génétique est devenue un outil fondamental en biologie de la conservation. Mes activités de recherche sont centrées sur la génétique de la conservation des espèces marines à fort potentiel de dispersion. J’utilise les outils moléculaires afin d’étudier la structure des populations, les réponses des organismes aux stress environnementaux et l’adaptation locale. Je travaille principalement sur deux projets au sein de l’équipe AMARE du LIENSs, et un projet en collaboration avec le CEBC (UMR 7372 CNRS-ULR) :
  • 1) Dans le cadre du projet DYPOMAR (programme CPER ECONAT, axe 2, thème 2), je m’intéresse à la réponse transcriptomique d’une espèce de bivalve (Mimachlamys varia) aux variations environnementales et à la contamination chimique dans un milieu intra-portuaire.
  • 2) Mon deuxième axe de recherche porte sur l’étude de la transmission uniparentale double et son implication dans la mise en place du processus adaptatif. Afin d’étudier ce phénomène chez la telline balthique (Limecola balthica), j’effectue l’analyse de données transcriptomiques comparatives entre le sperme, l’ovocyte et des cellules somatiques. Ces analyses permettront de mesurer le niveau de divergence avec les mitogénomes mâle et femelle, et d’établir le potentiel de divergence fonctionnelle entre ces deux génomes.
  • 3) L’objectif du projet que je mène en collaboration avec le CEBC (UMR 7372) et la Réserve des Terres Australes et Antarctiques Françaises est d’obtenir des informations clées, nécessaires à la protection du dauphin de Commerson de Kerguelen, une sous-espèce endémique, et pour laquelle les connaissances demeurent extrêmement limitées. Dans ce but, j’évalue le degré d’isolement entre les populations d’Amérique du Sud et Kerguelen (sud de l’Océan Indien) en mesurant la connectivité (différenciation génétique) par différents outils moléculaires.
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Principales collaborations :
  • Pascale Garcia, LIENSs, CNRS-Université de La Rochelle, UMR 7266
  • Eric Pante, LIENSs, CNRS-Université de La Rochelle, UMR 7266
  • Hélène Thomas-Guyon, LIENSs, CNRS-Université de La Rochelle, UMR 7266
  • Christophe Guinet, CEBC, CNRS-Université de La Rochelle, UMR UMR 7372
  • Christophe Barbraud, CEBC, CNRS-Université de La Rochelle, UMR UMR 7372
  • Benoit Simon-Bouhet, CEBC, CNRS-Université de La Rochelle, UMR 7372
  • Charles-André Bost, CEBC, CNRS-Université de La Rochelle, UMR 7372
  • Patricia E. Rosel, National Marine Fisheries Service, SEFSC, USA

Publications :
1auteurs à contributions égales

  • Rosel PE, Taylor BL, Hancock-Hanser BL, Morin PA, Archer FI, Lang AR, Mesnick SL, Pease VL, Perrin WF, Robertson KM, Leslie MS, Berta A, Cipriano F, Parsons KM, Viricel A, Vollmer NL, Martien KK (Accepté) A review of molecular genetic markers and analytical approaches that have been used for delimiting marine mammal subspecies and species. Marine Mammal Science (issue spéciale)
  • Rosel PE, Hancock-Hanser BL, Archer FI, Robertson KM, Martien KK, Leslie MS, Berta A, Cipriano F, Viricel A, Viaud-Martinez KA, Taylor BL (Accepté) Examining metrics and magnitudes of molecular genetic differentiation used to delimit cetacean subspecies based on mitochondrial DNA control region sequences. Marine Mammal Science (issue spéciale)
  • Martien KK, Taylor BL, Leslie MS, Morin PA, Rosel PE, Archer FI, Hancock-Hanser BL, Viricel A, Vollmer NL (Accepté) Analytical approaches to subspecies delimitation with genetic data. Marine Mammal Science (issue spéciale)
  • Viricel A, Simon-Bouhet B, Ceyrac L, Dulau-Drouot V, Berggren P, Amir OA, Jiddawi NS, Mongin P, Kiszka JJ. (2016) Habitat availability and geographic isolation as potential drivers of population structure in an oceanic dolphin in the Southwest Indian Ocean. Marine Biology 163:219
  • Breitwieser M1, Viricel A1, Graber M, Murillo L, Becquet V, Churlaud C, Fruitier-Arnaudin I, Huet V, Lacroix C, Pante E, Le Floch S, Thomas-Guyon H (2016) Short-term and long-term biological effects of chronic chemical contamination on natural populations of a marine bivalve. PLoS ONE 11(3):e0150184
  • Pante E, Abdelkrim J1, Viricel A1, Gey D, France S, Boisselier M-C, Samadi S (2015) Use of RAD sequencing for delimiting species. Heredity 114:450-459 DOI : 10.1038/hdy.2014.105
  • Biton S, Banaru D, Boudouresque CF, Dekeyser I, Viricel A, Merchán M (2015) DNA evidence of the consumption of short-beaked common dolphin Delphinus delphis by the shortfin mako shark Isurus oxyrinchus. Marine Ecology Progress Series 532:177-183
  • Pante E, Pascal P-Y, Becquet V, Viricel A, Simon-Bouhet B, Garcia P (2015) Evaluating the genetic effects of the invasive Ocenebra inornata on the native oyster drill Ocenebra erinacea. Marine Ecology 36(4):1118-1128 DOI : 10.1111/maec.12208
  • Sabatier E, Pante E, Dussud C, Van Canneyt O, Simon-Bouhet B, Viricel A (2015) Genetic monitoring of pilot whales, Globicephala spp. (Cetacea : Delphinidae), stranded on French coasts. Mammalia 79(1):111-114 DOI : 10.1515/mammalia-2013-0155
  • Pante E1, Puillandre N1, Viricel A1, Arnaud-Haond S, Aurelle D, Castelin M, Chenuil A, Destombe C, Forcioli D, Valero M, Viard F, Samadi S (2015) Species are hypotheses : avoid connectivity assessments based on pillars of sand. Molecular Ecology 24(3):525-544
  • Viricel A, Rosel PE (2014) Hierarchical population structure and habitat differences in a highly mobile marine species : the Atlantic spotted dolphin. Molecular Ecology 23(20):5018-5035
  • Viricel A, Pante E, Dabin W, Simon-Bouhet B (2014) Applicability of RAD-tag genotyping for inter-familial comparisons : empirical data from two cetaceans. Molecular Ecology Resources 14(3) : 597-605
  • Louis M, Viricel A, Lucas T, Peltier H, Alfonsi E, Berrow S, Brownlow A, Covelo P, Dabin W, Deaville R, de Stephanis R, Gally F, Gauffier P, Penrose R, Silva MA, Guinet C, Simon-Bouhet B (2014) Habitat-driven population structure of bottlenose dolphins, Tursiops truncatus, in the North-East Atlantic. Molecular Ecology 23(4):857-874
  • Alfonsi E, Meheust E, Fuchs S, Carpentier FG, Quillivic Y, Viricel A, Hassani S and Jung J-L (2013) The use of DNA barcoding to monitor the marine mammal biodiversity along the French Atlantic coast. Zookeys 365:5-24
  • Viricel A and Rosel PE (2012) Evaluating the utility of cox1 for cetacean species identification.
    Marine Mammal Science 28(1) : 37-62
  • Vollmer NL, Viricel A, Wilcox L, Moore K and Rosel PE (2011) The occurrence of mtDNA
    heteroplasmy in multiple cetacean species. Current Genetics 57(2) : 115-131
  • Viricel A, Strand AE, Rosel PE, Ridoux V and Garcia P (2008) Insights on common dolphin
    (Delphinus delphis) social organization from ; genetic analysis of a mass-stranded pod. Behavioral
    Ecology and Sociobiology 63(2):173-185
  • Baker T, Viricel A, Meraziz L and I de Buron (2005) Size Variation of Adult Polyopisthocotylid
    Metamicrocotyla macracantha (Monogenea) in Relation to Host Size. Comparative Parasitology
    72(2):179-182

Article de vulgarisation :

  • Viricel A and Pante E (2007) Utiliser la génétique pour mieux décrire, comprendre et protéger la nature. Le Courrier de la Nature 235 : 22-27

Activités d’enseignement :

  • >190 heures d’enseignement de CM, TD et TP au département de Biologie de l’ULR : Génétique fondamentale (L1), Macroévolution (L2), Microévolution (L3), Adaptation et Conservation (M1)
  • >480 heures d’enseignement de TPs d’introduction à la Biologie et d’Écologie (niveau Bachelor) dans deux universités américaines (College of Charleston et University of Louisiana at Lafayette).