LIttoral ENvironnement et Sociétés (LIENSs) - UMR 7266

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Agogué Hélène

Chercheur CNRS, CR1
Section de Recherche CNRS : section 30 (Surface continentale et interfaces)
Institut référent : INEE

Mots clés : Bacteria, Archaea, structure, diversité fonctionnelle, cycle biogéochimiques

Thèmes de Recherche.
Rôle des communautés bactériennes et archéennes dans les cycles biogéochimiques des écosystèmes littoraux
Mon activité de recherche concerne l’étude des procaryotes dans les écosystèmes aquatiques. Outre les communautés bactériennes, j’étudie les communautés archéennes. Ma recherche se subdivise en deux axes, en cohérence avec les axes de recherche de l’équipe BIOFEEL du LIENSs de la Rochelle (Dynamique fonctionnelle des écosystèmes littoraux et Enjeux environnementaux et sociétaux des écosystèmes littoraux). Le premier axe de ma recherche vise à étudier et à caractériser la diversité fonctionnelle des procaryotes et de leurs interactions dans différents écosystèmes littoraux en milieu tempéré : l’estuaire de la Charente, les marais littoraux, les lagunes, les vasières intertidales, la station SOMLIT Antioche …mais également dans d’autres écosystèmes tropicaux.

Pour mener à bien ces travaux, je combine des approches d’observation et d’échantillonnage sur le terrain (suivi temporel et spatial) et des approches en laboratoire (utilisation de mésocosmes). Mon deuxième axe de recherche concerne la compréhension des enjeux environnementaux et sociétaux dans les écosystèmes littoraux au prisme de l’étude de la biodiversité microbienne. Ainsi, je participe à des réflexions interdisciplinaires au sein notamment du laboratoire LIENSs et apporte des informations concernant les fonctions naturelles (biodiversité, fonctionnement biogéochimique et fonctions écosystémiques) de ce compartiment microbien invisible mais pourtant primordial au fonctionnement des écosystèmes littoraux et et à la préservation de leur biodiversité.


Principales collaborations :
  • Pr Magali Ader et Dr. Emmanuelle Gérard, Institut de Physique du Globe, Paris, France
  • Pr Cécile Bernard, Muséum d’Histoire Naturelle, Paris, France
  • Dr Marc Bouvy, Dr Christophe Leboulanger et Jean Christophe Auguet, Laboratoire Écologie des systèmes marins côtier, Montpellier, France
  • Pr Jun Gong and Dr. Xialo Zhang, Yantai Institute of Coastal Research, Yantai, Chine
  • Dr Mylène Hugoni, Laboratoire Ecologie Microbienne, Lyon, France
  • Dr Anniet Laverman, Laboratoire Ecosystèmes, Biodiversité, Evolutio ; Rennes, France
  • Dr Aude Leynaert, Laboratoire des sciences de l’Environnement Marin, Brest, France
  • Dr. Isabelle Mary et Dr Clarisse Mallet, Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement, Université Blaise Pascal, Clermont Ferrand
  • Dr. Cindy Smith, NUIG, Galway, Irlande

Liste des publications :

61 résultats

2024

Article dans une revue

Importance of eukaryotes in shaping microbial benthic communities in Charente-maritime marshes, France
Clélia Duran , Andréa Bouchard , Hélène Agogué , Christine Dupuy , Robert Duran , Cristiana Cravo-Laureau
Science of the Total Environment, 2024, 957, ⟨10.1016/j.scitotenv.2024.177523⟩
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Lineage-dependent partitioning of activities in chemoclines defines Woesearchaeota ecotypes in an extreme aquatic ecosystem
Lilian A Cloarec , Thomas Bacchetta , Maxime Bruto , Christophe Leboulanger , Vincent Grossi , Céline Brochier-Armanet , Jean-Pierre Flandrois , Adrian Zurmely , Cécile Bernard , Marc Troussellier , Hélène Agogué , Magali Ader , Christine Oger-Desfeux , Philippe M Oger , Adrien Vigneron , Mylène Hugoni
Microbiome, 2024, 12 (1), pp.249. ⟨10.1186/s40168-024-01956-0⟩
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Seismic events as potential drivers of the microbial community structure and evolution in a paleo-ocean analog
Adrien Vigneron , Lilian Cloarec , Hélène Agogué , Cécile Bernard , Sébastien Duperron , Christophe Leboulanger , Claire Carré , Patrice Got , Cécile Roques , Marc Troussellier , Didier Jézéquel , Alexis Groleau , Magali Ader , Phil M. Oger , Mylène Hugoni
Communications Earth & Environment, 2024, 5 (1), pp.504. ⟨10.1038/s43247-024-01615-0⟩
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Transcriptomic insights into the dominance of two phototrophs throughout the water column of a tropical hypersaline-alkaline crater lake (Dziani Dzaha, Mayotte)
Sébastien Duperron , Sébastien Halary , Jean-Pierre Bouly , Théotime Roussel , Mylène Hugoni , Maxime Bruto , Phil M. Oger , Charlotte Duval , Anthony C. Woo , Didier Jézéquel , Magali Ader , Christophe Leboulanger , Hélène Agogué , Vincent Grossi , Marc Troussellier , Cécile Bernard
Frontiers in Microbiology, 2024, 15, pp.1368523. ⟨10.3389/fmicb.2024.1368523⟩
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Low-abundant but highly transcriptionally active uncharacterised Nitrosomonas drive ammonia-oxidation in the Brouage mudflat, France
Fabien Cholet , Hélène Agogué , Umer Z Ijaz , Nicolas Lachaussée , Philippe Pineau , Cindy J Smith
Science of the Total Environment, 2024, 946, pp.174312. ⟨10.1016/j.scitotenv.2024.174312⟩
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2023

Article dans une revue

Data quality control considerations in multivariate environmental monitoring: experience of the French coastal network SOMLIT
Elsa Breton , Nicolas Savoye , Peggy Rimmelin-Maury , Benoit Sautour , Eric Goberville , Arnaud Lheureux , Thierry Cariou , Sophie Ferreira , Hélène Agogué , Samir Alliouane , Fabien Aubert , Sébastien Aubin , Eric Berthebaud , Hadrien Blayac , Lucie Blondel , Cédric Boulart , Yann Bozec , Sarah Bureau , Arnaud Caillo , Arnaud Cauvin , Jean-Baptiste Cazes , Léo Chasselin , Pascal Claquin , Pascal Conan , Marie-Ange Cordier , Laurence Costes , Romain Crec’hriou , Olivier Crispi , Muriel Crouvoisier , Valérie David , Yolanda del Amo , Hortense de Lary , Gaspard Delebecq , Jeremy Devesa , Aurélien Domeau , Maria Durozier , Claire Emery , Eric Feunteun , Juliette Fauchot , Valérie Gentilhomme , Sandrine Geslin , Mélanie Giraud , Karine Grangeré , Gerald Grégori , Emilie Grossteffan , Aurore Gueux , Julien Guillaudeau , Gael Guillou , Manon Harrewyn , Orianne Jolly , Florence Jude-Lemeilleur , Paul Labatut , Nathalie Labourdette , Nicolas Lachaussée , Michel Lafont , Veronique Lagadec , Christophe Lambert , Jezebel Lamoureux , Laurent Lanceleur , Benoit Lebreton , Eric Lecuyer , David Lemeille , Yann Leredde , Cédric Leroux , Aude Leynaert , Stéphane L'Helguen , Camilla Liénart , Eric Macé , Eric Maria , Barbara Marie , Dominique Marie , Sébastien Mas , Line Mornet , Behzad Mostajir , Laure Mousseau , Antoine Nowaczyk , Sandra Nunige , René Parra , Thomas Paulin , David Pecqueur , Franck Petit , Philippe Pineau , Patrick Raimbault , Fabienne Rigaut-Jalabert , Christophe Salmeron , Ian Salter , Pierre-Guy Sauriau , Laurent Seuront , Emmanuelle Sultan , Rémi Valdès , Vincent Vantrepotte , Francesca Vidussi , Florian Voron , Renaud Vuillemin , Laurent Zudaire , Nicole Garcia
Frontiers in Marine Science, 2023, 10, pp.12. ⟨10.3389/fmars.2023.1135446⟩
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Les usagers d’une plage péri-urbaine face à la contamination microbiologique des eaux de baignade
Maëlig Le Béguec , Emmanuelle Petit , Luc Vacher , Hélène Agogué , Mery Ndione
VertigO : La revue électronique en sciences de l'environnement, 2023, Volume 23 (numéro 1), ⟨10.4000/vertigo.40071⟩
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Phytoplanktonic species in the haloalkaline Lake Dziani Dzaha select their archaeal microbiome
Maxime Bruto , Phil M. Oger , Patrice Got , Cécile Bernard , Delphine Melayah , Lilian Cloarec , Charlotte Duval , Arthur Escalas , Sébastien Duperron , Ludivine Guigard , Christophe Leboulanger , Magali Ader , Gerard Sarazin , Didier Jézéquel , Hélène Agogué , Marc Troussellier , Mylène Hugoni
Molecular Ecology, 2023, 32 (24), pp.6824-6838. ⟨10.1111/mec.17179⟩
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Distribution and trophic functioning of planktonic communities in coastal marshes in Atlantic Coast of France
Lauriane Bergeon , Frédéric Azémar , Claire Carré , Bénédicte Dubillot , Claire Emery , Hélène Agogué , Philippe Pineau , Thomas Lacoue-Labarthe , Marc Bouvy , Michèle Tackx , Christine Dupuy
Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2023, pp.108430. ⟨10.1016/j.ecss.2023.108430⟩
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Communication dans un congrès

Une grille de lecture innovante pour caractériser le patrimoine des marais littoraux.
Nathalie Long , Hélène Agogué , Cécilia Pignon-Mussaud , Christine Dupuy , Mickael Augeron , Lauriane Bergeon , François Brischoux , Jean-Michel Carozza , Clarisse Cazals , Eric Chaumillon , Olivier De Viron , Clémence Dedinger , Emmanuel Dubillot , Sylvie Ferrari , Jérôme Jourde , Mireia Kolher , Sébastien Lavaud , Léa Lorrain-Solignon , Jean-Christophe Pereau , Audrey Rivaud , Thierry Sauzeau , Ornella Siger , Thomas Lacoue-Labarthe , Marie Vagner , Nicolas Becu
Colloque de restitution PAMPAS « Le patrimoine des marais littoraux face aux changements globaux », Projet de recherche collaborative PAMPAS : Évolution de l'identité patrimoniale des marais des Pertuis Charentais en réponse à l'aléa de submersion marine, Nov 2023, La Rochelle, France
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Restoring an urbanized coastal marsh: consequences on contamination dynamics
Adélaïde Lerebours , Mireia Kohler , Lauriane Bergeron , Jeanne Latreille De Lavarde , Bénédicte Dubillot , J. Jourde , Christine Dupuy , Elodie Réveillac , Marie Vagner , Hélène Agogué , Thomas Lacoue-Labarthe
COAST CAEN 2023 - Entre Terre et Mer - Conférence Internationale d’Océanographie et 19ème Symposium Franco-Japonais d’Océanographie, Oct 2023, Caen, France
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Structure et fonctionnement du plancton des marais des Pertuis Charentais et effet de l’aléa submersion sur les fonctions écologiques (épuration, nourricerie).
Lauriane Bergeon , Christine Dupuy , Frédéric Azémar , Bénédicte Dubillot , Marc Bouvy , Claire Carré , Pierre Polsenaere , Jérémy Mayen , Hélène Agogué , Mathieu Paoletti , Philippe Pineau , Claire Emery , Valérie Huet , Thierry Guyot , Pascaline Ory , Emmanuel Dubillot , Nathalie Long , Nicolas Becu , Thomas Lacoue-Labarthe , Marie Vagner , Michèle Tackx
Colloque PAMPAS « Le patrimoine des marais littoraux face aux changements globaux», Projet PAMPAS, 2023, La Rochelle, France
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Impact des submersions marines sur les marais littoraux des Pertuis Charentais : une approche multidisciplinaire
Benjamin Amann , Eric Chaumillon , Pierre Polsenaere , Julien Pétillon , Jérémy Mayen , Marie Arnaud , Christine Dupuy , Lauriane Bergeon , Léa Lorrain-Soligon , François Brischoux , Clémence Dedinger , Clarisse Cazals , Cécilia Pignon-Mussaud , Xavier Bertin , Mireia Kohler , Élodie Réveillac , Hélène Agogué , Jérôme Jourde , Nathalie Long , Thomas Lacoue-Labarthe , Nicolas Bécu , Marie Vagner
Colloque PAMPAS « Le patrimoine des marais littoraux face aux changements globaux», 2023, La Rochelle, France
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2022

Article dans une revue

Archaea Carotenoids: Natural Pigments with Unexplored Innovative Potential
Antoine Grivard , Isabelle Goubet , Luiz Miranda de Souza Duarte Filho , Valérie Thiéry , Sylvie Chevalier , Raimundo Gonçalves de Oliveira Júnior , Noureddine El Aouad , Jackson Roberto Guedes da Silva Almeida , Przemysław Sitarek , Lucindo José Quintans-Junior , Raphaël Grougnet , Hélène Agogué , Laurent Picot
Marine drugs, 2022, Marine Pigments, 20 (8), pp.524. ⟨10.3390/md20080524⟩
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Ecological Observations Based on Functional Gene Sequencing Are Sensitive to the Amplicon Processing Method
Fabien Cholet , Agata Lisik , Hélène Agogué , Umer Z. Ijaz , Philippe Pineau , Nicolas Lachaussée , Cindy J. Smith
MSphere, 2022, 7, ⟨10.1128/msphere.00324-22⟩
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Temporal variations in fecal indicator bacteria in bathing water and sediment in a coastal ecosystem (Aytré Bay, Charente-Maritime, France)
Méry Ndione , Pascaline Ory , Tony Agion , Michaël Treilles , Luc Vacher , Benoit Simon-Bouhet , Maëlig Le Beguec , Philippe Pineau , Hélène Montanié , Hélène Agogué
Marine Pollution Bulletin, 2022, 175, pp.113360. ⟨10.1016/j.marpolbul.2022.113360⟩
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Do microbial planktonic communities reflect the ecological changes of Glorieuses coral reefs (Iles Eparses, Western Indian Ocean)?
Marc Bouvy , Alice Belieres , Claire Carré , Patrice Got , Marc Pagano , Hélène Agogué , Beatrice Bec , Cécile Roques , Lionel Bigot , Pascale Chabanet , Christine Dupuy
Marine Pollution Bulletin, 2022, 174, pp.113218. ⟨10.1016/j.marpolbul.2021.113218⟩
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Influence of aphotic haloclines and euxinia on organic biomarkers and microbial communities in a thalassohaline and alkaline volcanic crater lake
David Sala , Vincent Grossi , Hélène Agogué , Christophe Leboulanger , Didier Jézéquel , Gérard Sarazin , Ingrid Antheaume , Cécile Bernard , Magali Ader , Mylène Hugoni
Geobiology, 2022, 20 (2), pp.292-309. ⟨10.1111/gbi.12477⟩
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Strong reorganization of multi-domain microbial networks associated with primary producers sedimentation from oxic to anoxic conditions in an hypersaline lake
Arthur Escalas , Marc Troussellier , Delphine Melayah , Maxime Bruto , Nicolas Sébastien , Cécile Bernard , Magali Ader , Christophe Leboulanger , Hélène Agogué , Mylène Hugoni
FEMS Microbiology Ecology, 2022, 97 (12), pp.fiab163. ⟨10.1093/femsec/fiab163⟩
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2021

Article dans une revue

New insights in bacterial and eukaryotic diversity of microbial mats inhabiting exploited and abandoned salterns at the Ré Island (France)
Camille Mazière , Hélène Agogué , Cristiana Cravo-Laureau , Christine Cagnon , Isabelle Lanneluc , Sophie Sablé , Ingrid Fruitier-Arnaudin , Christine Dupuy , Robert Duran
Microbiological Research, 2021, 252, ⟨10.1016/j.micres.2021.126854⟩
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2020

Article dans une revue

Morphology and Ecology of Two New Amoebae, Isolated From a Thalassohaline Lake, Dziani Dzaha
Willy Aucher , Vincent Delafont , Elodie Ponlaitiac , Aurélien Alafaci , Hélène Agogué , Christophe Leboulanger , Marc Bouvy , Yann Héchard
Protist, 2020, 171 (6), pp.125770. ⟨10.1016/j.protis.2020.125770⟩
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Trophic niche partitioning in marine wood-borers revealed by stable isotope analysis
François Charles , Pascal Riera , Pierre-Guy Sauriau , François Lantoine , Benoit Lebreton , Hélène Agogué , Stéphane Hourdez
Aquatic Biology, 2020, 29, pp.33-43. ⟨10.3354/ab00723⟩
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Ecological succession and resilience of plankton recovering from an acute disturbance in freshwater marshes
Valérie V. David , Sébastien Tortajada , Olivier Philippine , Martine Bréret , Alexandre Barnett Barnett , Hélène Agogué , François-Xavier Robin , Christine Dupuy
Science of the Total Environment, 2020, 709, pp.135997. ⟨10.1016/j.scitotenv.2019.135997⟩
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Geochemistry of an endorheic thalassohaline ecosystem: the Dziani Dzaha crater lake (Mayotte Archipelago, Indian Ocean)
Gérard Sarazin , Didier Jézéquel , Christophe Leboulanger , Eric Fouilland , Emilie Le Floc'H , Marc Bouvy , Emmanuelle Gérard , Hélène Agogué , Cécile Bernard , Mylène Hugoni , Vincent Grossi , Marc Troussellier , Magali Ader
Comptes Rendus Géoscience, 2020, ⟨10.5802/crgeos.43⟩
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2019

Article dans une revue

Very Low Phytoplankton Diversity in a Tropical Saline-Alkaline Lake, with Co-dominance of Arthrospira fusiformis (Cyanobacteria) and Picocystis salinarum (Chlorophyta)
Cécile Bernard , Arthur Escalas , Nicolas Villeriot , Hélène Agogué , Mylène Hugoni , Charlotte Duval , Claire Carré , Patrice Got , Gérard Sarazin , Didier Jézéquel , Christophe Leboulanger , Vincent Grossi , Maga Ader , Marc Troussellier
Microbial ecology, 2019, 78 (3), pp.603-617. ⟨10.1007/s00248-019-01332-8⟩
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Communication dans un congrès

Stratégie d’analyse d’une contamination fécale (bactéries et virus) dans un espace littoral interdit à la baignade : cas de la baie d’Aytré (Charente-Maritime, France)
Méry Ndione , Hélène Agogué , Tony Agion , Michael Treilles , Luc Vacher , Hélène Montanié
Congrès de Société Française de Microbiologie (SFM), Oct 2019, Paris, France
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2018

Article dans une revue

Spatiotemporal variations in microbial diversity across the three domains of life in a tropical thalassohaline lake (Dziani Dzaha, Mayotte Island)
Mylène Hugoni , Arthur Escalas , Cécile Bernard , Sébastien Nicolas , Didier Jezequel , Fanny Vazzoler , Gérard Sarazin , Christophe Leboulanger , Marc Bouvy , Patrice Got , Magali Ader , Marc Troussellier , Hélène Agogué
Molecular Ecology, 2018, 27 (23), pp.4775-4786. ⟨10.1111/mec.14901⟩
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Characterization of phototrophic microorganisms and description of new cyanobacteria isolated from the saline-alkaline crater-lake Dziani Dzaha (Mayotte, Indian Ocean)
Maria Cellamare , Charlotte Duval , Yannick Drelin , Chakib Djediat , Nour Touibi , Hélène Agogué , Christophe Leboulanger , Magali Ader , Cécile Bernard
FEMS Microbiology Ecology, 2018, 94 (8), pp.fiy108. ⟨10.1093/femsec/fiy108⟩
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Diel rhythm does not shape the vertical distribution of bacterial and archaeal 16S rRNA transcript diversity in intertidal sediments: a mesocosm study Running title: Diel activities of benthic Bacteria and Archaea
Céline Lavergne , Mylène Hugoni , Cédric Hubas , Didier Debroas , Christine Dupuy , Hélène Agogué
Microbial ecology, 2018, 75 (2), pp.364-374. ⟨10.1007/s00248-017-1048-1⟩
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First evidence of the presence and activity of archaeal C3 group members in an Atlantic intertidal mudflat
Céline Lavergne , Mylène Hugoni , Christine Dupuy , Hélène Agogué
Scientific Reports, 2018, 8 (1), pp.11790. ⟨10.1038/s41598-018-30222-1⟩
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Key Role of Alphaproteobacteria and Cyanobacteria in the Formation of Stromatolites of Lake Dziani Dzaha (Mayotte, Western Indian Ocean)
Emmanuelle Gérard , Siham de Goeyse , Mylène Hugoni , Hélène Agogué , Laurent Richard , Vincent Milesi , François Guyot , Léna Lecourt , Stephan Borensztajn , Marie-Béatrice Joseph , Thomas Leclerc , Gérard Sarazin , Didier Jézéquel , Christophe Leboulanger , Magali Ader
Frontiers in Microbiology, 2018, 9, pp.796. ⟨10.3389/fmicb.2018.00796⟩
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2017

Article dans une revue

Effect of bacteria on growth and biochemical composition of two benthic diatoms Halamphora coffeaeformis and Entomoneis paludosa
Thierry Jauffrais , Hélène Agogué , Marin-Pierre Gemin , Laureen Beaugeard , Véronique Martin-Jézéquel
Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 2017, 495, pp.65 - 74. ⟨10.1016/j.jembe.2017.06.004⟩
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Factors influencing prokaryotes in an intertidal mudflat and the resulting depth gradients
Céline Lavergne , Hélène Agogué , Aude Leynaert , Mélanie Raimonet , Rutger de Wit , Philippe Pineau , Martine Bréret , Nicolas Lachaussée , Christine Dupuy
Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2017, 189, pp.74 - 83. ⟨10.1016/j.ecss.2017.03.008⟩
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Microbial Diversity and Cyanobacterial Production in Dziani Dzaha Crater Lake, a Unique Tropical Thalassohaline Environment
Christophe Leboulanger , Hélène Agogué , Cécile Bernard , Marc Bouvy , Claire Carré , Maria Cellamare , Charlotte Duval , Eric Fouilland , Patrice Got , Laurent Intertaglia , Céline Lavergne , Emilie Le Floc'H , Cécile Roques , Gérard Sarazin
PLoS ONE, 2017, 12 (1), pp.e0168879. ⟨10.1371/journal.pone.0168879⟩
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2016

Article dans une revue

Response of Core Microbial Consortia to Chronic Hydrocarbon Contaminations in Coastal Sediment Habitats
Mathilde Jeanbille , Jérôme Gury , Robert Duran , Jacek Tronczynski , Hélène Agogué , Olfa Ben Saïd , Jean-François Ghiglione , J.-C. Auguet
Frontiers in Microbiology, 2016, 7, pp.1637. ⟨10.3389/fmicb.2016.01637⟩
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Chronic Polyaromatic Hydrocarbon (PAH) Contamination Is a Marginal Driver for Community Diversity and Prokaryotic Predicted Functioning in Coastal Sediments
Mathilde Jeanbille , Jérôme Gury , Robert Duran , Jacek Tronczynski , Jean-François Ghiglione , Hélène Agogué , Olfa Ben Saïd , Najwa Taïb , Didier Debroas , Cédric Garnier , J.-C. Auguet
Frontiers in Microbiology, 2016, 7, pp.1303. ⟨10.3389/fmicb.2016.01303⟩
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2015

Article dans une revue

Structure and functional characteristics of the meiofauna community in highly unstable intertidal mudbanks in Suriname and French Guiana (North Atlantic coast of South America)
Christine Dupuy , Hien Thanh Nguyen , David Mizrahi , Jérôme Jourde , Martine Bréret , Hélène Agogué , Laureen Beaugeard , Pierrick Bocher
Continental Shelf Research, 2015, ⟨10.1016/j.csr.2015.09.019⟩
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Temporal Dynamics of Active Prokaryotic Nitrifiers and Archaeal Communities from River to Sea
Mylène Hugoni , Hélène Agogué , Najwa Taib , Isabelle Domaizon , Anne Moné , Pierre E. Galand , Gisèle Bronner , Didier Debroas , Isabelle Mary
Aquatic Microbial Ecology, 2015, 70 (2), pp.473-483. ⟨10.1007/s00248-015-0601-z⟩
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Contrasting spatiotemporal patterns and environmental drivers of diversity and community structure of ammonia oxidizers, denitrifiers, and anammox bacteria in sediments of estuarine tidal flats
Anjing Yang , Xiaoli Zhang , Hélène Agogué , Christine Dupuy , Jun Gong
Annals of Microbiology, 2015, 65 (879-890), http://link.springer.com/journal/13213. ⟨10.1007/s13213-014-0929-5⟩
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Temporal dynamics of active Archaea in oxygen-depleted zones of two deep lakes
Mylène Hugoni , Isabelle Domaizon , Najwa Taib , Corinne Biderre-Petit , Hélène Agogué , Pierre E. Galand , Didier Debroas , Isabelle Mary
Environmental Microbiology Reports, 2015, 7 (2), pp.321-329. ⟨10.1111/1758-2229.12251⟩
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Di and tripeptides from marine sources can target adipogenic process and contribute to decrease adipocyte number and functions
Yesmine Ben Henda , Mariem Laamari , Isabelle Lanneluc , Marie-Agnès Travers , Hélène Agogué , Ingrid Arnaudin , Nicolas Bridiau , Thierry Maugard , Jean-Marie Piot , Frédéric Sannier , Stéphanie Bordenave-Juchereau
Journal of Functional Foods, 2015, Journal of Functional Foods, 17, pp.1-10. ⟨10.1016/j.jff.2015.04.050⟩
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2014

Article dans une revue

How does the resuspension of the biofilm alter the functioning of the benthos–pelagos coupled food web of a bare mudflat in Marennes-Oléron Bay (NE Atlantic)?
Blanche Saint-Béat , Christine Dupuy , Hélène Agogué , Alexandre Carpentier , Julien Chalumeau , Serena Como , Valérie David , Margot de Crignis , Jean-Claude Duchêne , Camille Fontaine , Eric Feunteun , Katell Guizien , Hans Hartmann , Johann Lavaud , Sébastien Lefebvre , Christel Lefrançois , Clarisse Mallet , Hélène Montanié , Jean-Luc Mouget , Francis Orvain , Pascaline Ory , Pierre-Yves Pascal , Gilles Radenac , Pierre Richard , Nathalie Niquil
Journal of Sea Research (JSR), 2014, 92, pp.144-157. ⟨10.1016/j.seares.2014.02.003⟩
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DOI
Bacterial dynamics in a microphytobenthic biofilm: A tidal mesocosm approach
Hélène Agogué , Clarisse Mallet , Francis Orvain , Margot de Crignis , Françoise Mornet , Christine Dupuy
Journal of Sea Research (JSR), 2014, Trophic significance of microbial biofilm in tidal flats, 92, pp.36 - 45. ⟨10.1016/j.seares.2014.03.003⟩
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Relative Abundance of Ammonia Oxidizers, Denitrifiers, and Anammox Bacteria in Sediments of Hypernutrified Estuarine Tidal Flats and in Relation to Environmental Conditions
Xiaoli Zhang , Hélène Agogué , Christine Dupuy , Jun Gong
CLEAN - Soil, Air, Water, 2014, 42 (6), pp.815-823. ⟨10.1002/clen.201300013⟩
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Structures of benthic prokaryotic communities and their hydrolytic enzyme activities resuspended from samples of intertidal mudflats: An experimental approach
Clarisse Mallet , Hélène Agogué , Frédérique Bonnemoy , Katell Guizien , Francis Orvain , Christine Dupuy
Journal of Sea Research (JSR), 2014, Trophic significance of microbial biofilm in tidal flats, 92, pp.158-169. ⟨10.1016/j.seares.2014.01.005⟩
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2013

Article dans une revue

Isolation and distribution of iridescent Cellulophaga and further iridescent marine bacteria in the Charente Maritime coast, French Atlantic coast
Betty Kientz , Hélène Agogué , Céline Lavergne , Pauline Marié , Eric Rosenfeld
Systematic and Applied Microbiology, 2013, 36 (4), pp.244-251. ⟨10.1016/j.syapm.2013.02.004⟩
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Structure of the rare archaeal biosphere and seasonal dynamics of active ecotypes in surface coastal waters
Mylène Hugoni , Najwa Taib , Didier Debroas , Isabelle Domaizon , Isabelle Jouan-Dufournel , Gisèle Bronner , Ian Salter , Hélène Agogué , Isabelle Mary , Pierre E. Galand
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2013, 110 (15), pp.6004-6009. ⟨10.1073/pnas.1216863110⟩
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2011

Article dans une revue

Water mass-specificity of bacterial communities in the North Atlantic revealed by massively parallel sequencing
Hélène Agogué , Dominique Lamy , Phillip R Neal , Mitchell S Sogin , Gerhard J Herndl
Molecular Ecology, 2011, 20, http://onlinelibrary.wiley.com/journal/10.1111/%28ISSN%291365-294X. ⟨10.1111/j.1365-294X.2010.04932.x⟩
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2008

Article dans une revue

Major gradients in putatively nitrifying and non-nitrifying Archaea in the deep North Atlantic
Hélène Agogué , Maaike Brink , Julie Dinasquet , Gerhard J Herndl
Nature, 2008, 456, pp.788 - 791. ⟨10.1038/nature07535⟩
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Spatial distribution of Bacteria and Archaea and amoA gene copy numbers throughout the water column of the Eastern Mediterranean Sea
Daniele de Corte , Taichi Yokokawa , Hélène Agogué , Marta M. Varela , Gerhard J Herndl
The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2008, ⟨10.1038/ismej.2008.94⟩
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DOI
Regulation of aquatic microbial processes: the ‘microbial loop’ of the sunlit surface waters and the dark ocean dissected
Gerhard J. Herndl , Hélène Agogué , Federico Baltar , Thomas Reinthaler , Eva Sintes , Marta M. Varela
Aquatic Microbial Ecology, 2008, 53, pp.59-68. ⟨10.3354/ame01225⟩
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Melitea salexigens gen. nov., sp. nov., a gammaproteobacterium from the Mediterranean Sea
Laurent Urios , Hélène Agogué , Laurent Intertaglia , Françoise Lesongeur , Philippe Lebaron
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2008, 58, pp.2489-2483. ⟨10.1099/ijs.0.65685-0⟩
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2006

Article dans une revue

Microbial community structure in the sea surface microlayer at two contrasting coastal sites in the northwestern Mediterranean Sea
Fabien Joux , Hélène Agogué , Ingrid Obernosterer , Christine Dupuy , Thomas Reinthaler , Gerhard J Herndl , Philippe Lebaron
Aquatic Microbial Ecology, 2006, 42, pp.91-104. ⟨10.3354/ame042091⟩
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Balneola vulgaris gen. nov., sp. nov., a member of the phylum Bacteroidetes from the north-western Mediterranean Sea
Laurent Urios , Hélène Agogué , Françoise Lesongeur , Erko Stackebrandt , Philippe Lebaron
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2006, 56 (8), pp.1883-1887. ⟨10.1099/ijs.0.64285-0⟩
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2005

Article dans une revue

Resistance of Marine Bacterioneuston to Solar Radiation
Hélène Agogué , Fabien Joux , Ingrid Obernosterer , Philippe Lebaron
Applied and Environmental Microbiology, 2005, 71, pp.5282 - 5289. ⟨10.1128/AEM.71.9.5282–5289.2005⟩
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A survey on bacteria inhabiting the sea surface microlayer of coastal ecosystems
Hélène Agogué , Emilio O. Casamayor , Muriel Bourrain , Ingrid Obernosterer , Fabien Joux , Gerhard J. Herndl , Philippe Lebaron
FEMS Microbiology Ecology, 2005, 54, pp.269-280. ⟨10.1016/j.femsec.2005.04.002⟩
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Resistance of Marine Bacterioneuston to Solar Radiation
Hélène Agogué , Fabien Joux , Ingrid Obernosterer , Philippe Lebaron
Applied and Environmental Microbiology, 2005, 71 (9), pp.5282-5289
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A survey on bacteria inhabiting the sea surface microlayer of coastal ecosystems
Hélène Agogué , Emilio O. Casamayor , Muriel Bourrain , Ingrid Obernosterer , Fabien Joux , Gerhard J. Herndl , Philippe Lebaron
FEMS Microbiology Ecology, 2005, 54, pp.269-280
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2004

Article dans une revue

Comparison of samplers for the biological characterization of the sea surface microlayer
Hélène Agogué , Emilio O. Casamayor , Fabien Joux , Ingrid Obernosterer , Christine Dupuy , François Lantoine , Philippe Catala , Markus G Weinbauer , Thomas Reinthaler , Gerhard J. Herndl , Philippe Lebaron
Limnology and Oceanography : methods, 2004, 2, pp.213-225. ⟨10.4319/lom.2004.2.213⟩
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2001

Article dans une revue

Does the High Nucleic Acid Content of Individual Bacterial Cells Allow Us To Discriminate between Active Cells and Inactive Cells in Aquatic Systems?
Philippe Lebaron , Pierre Servais , Helene Agogué , Claude Courties , Fabien Joux
Applied and Environmental Microbiology, 2001, 67, pp.1775 - 1782. ⟨10.1128/AEM.67.4.1775–1782.2001⟩
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Are the actively respiring cells (CTC+) those responsible for bacterial production in aquatic environments?
Pierre Servais , Hélène Agogué , Claude Courties , Fabien Joux , Philippe Lebaron
FEMS Microbiology Ecology, 2001, 35, pp.171 - 179. ⟨10.1016/S0168-6496(01)00089-7⟩
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