LIttoral ENvironnement et Sociétés (LIENSs) - UMR 7266

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Dupuy Christine

Professeur classe exceptionnelle 2
La Rochelle Université
Section de Recherche : CNU 67
Institut scientifique du CNRS référent : INEE

Mots clés : Ecologie aquatique, écologie microbienne, écologie trophique, Carbone Bleu, structure et fonctionnement du réseau trophique microbien en milieu côtier (benthique et pélagique)

  • Encadrements de 21 Thèses (dont 3 en cours à l’ED Euclide), 4 post-docs, 17 Masters 2 Recherche.
Tâches collectives et expertises :
  • Directrice-adjointe du laboratoire LIENSs depuis 2020
  • PCR du laboratoire de Radioécologie de LIENSs
  • Expert nommée de la section CNU 67 pour l’AERES et HCERES (7 fois) dans le cadre de l’évaluation d’un laboratoire ou observatoire et pour l’HCERES en 2015 pour l’évaluation de formations
  • Expertise de travaux scientifiques : articles, HDR, thèses, projets nationaux et internationaux, comités de thèse. Participation à des comités de recrutement : ITA, ITRF, MCF, PR
  • Membre du CS du Centre National de Ressources Biologiques Marines - Infrastructure Nationale en Biologie et Santé - EMBRC-France (Paris Sorbonne) (2018-2021)
  • Expert pour l’ANR CE32 (Dynamique des socio-écosystèmes et de leurs composants en vue de leur gestion durable, 2018-2021) et expert pour le programme « Restauration de la Sélune »
  • Membre du comité d’évaluation EC2CO HYBIGE depuis 2021
  • Membre des conseils scientifiques de la Sélune, du conseil scientifique de l’Observatoire Patrimoine Naturel Littoral (RNF-Agence française de la biodiversité : AFB), du conseil scientifique du forum des marais atlantique (FMA), du conseil scientifique du Parc naturel régional du marais Poitevin
  • Membre extérieure du CS de l’EPHE depuis 2022
  • Depuis septembre 2022 : membre du directoire de la fédération LUDI « Littoral urbain durable intelligent » (CNRS/La Rochelle Université)
  • Depuis 2024 : Membre du comité de recrutement du CSS3 de l’IRD, CR et DR
Responsabilités dans des projets de recherche :
  • Coordinatrice du programme ANR VASIREMI (2006-2011)
  • Coordinatrice des travaux de La Rochelle dans le programme européen/ ANR EraNet MariFish REPROdUCE (2010-2013)
  • Coordinatrice d’un programme de recherche sur les indicateurs de santé des zones humides (2011-2019)
  • Coordinatrice du programme CNRS/NSFC, France/Chine (2013)
  • Coordinatrice d’un axe du projet FEDER/CPER d’établissement (2015-2020) pour l’Université de la Rochelle
  • Coordinatrice d’un levier « carbone bleu » dans un projet du territoire innovant de grande ambition (TIGA, PIA3) : La Rochelle, territoire zéro carbone en 2040 (2018-2027)
  • Co-responsable d’un WP d’une ANR « Pampas » (2018-2022)
  • Coordinatrice pour le laboratoire du projet BIOMIC (Bioindicateurs microbiens des changements globaux en zone côtière du SUDOE), programme INTERREG SUDOE (2019-2022)
  • Coordinatrice pour le laboratoire du projet TETRAE (Transition en territoires de l’Agriculture, l’alimentation et l’environnement), MAVI : Maintenir des marais vivants face au changement climatique (2022-2027)
  • Co-responsable d’un WP du PPR RIOMAR (2023-2028)
  • Co-responsable d’un WP du PEPR Faircarbon Cabestan (2023-2027)
  • Co-responsable d’un WP du PEPR Faircarbon PC5 (2023-2027)
  • Coordinatrice du projet SEE-LIFE (CNRS INEE) sur "Suivi à long terme des ressources de bas niveaux trophiques (phytoplancton et métazooplancton) dans le cadre des campagnes écosystémiques de la zone Golfe de Gascogne et d’un réseau de stations côtières dans le Golfe de Gascogne" (2023-2027)
  • Coordinatrice pour le laboratoire du projet ESA Blue Carbon project (2024-2026)
  • Coordinatrice pour le laboratoire du projet LIFE MARAISILIENCE : Gouvernance et information sur le climat pour le Marais poitevin (2024-2028)
Taches électives :
  • Membre élue à la section 67 du CNU (2007-2009 et de 2011-2019)
  • 2015-2018 et 2019 : Membre élu du conseil d’UFR de la FST, représentante du conseil d’UFR à la commission recherche et à la commission des BIATSS
  • 2016-2019 : Membre élue de la CR de l’université de la rochelle
  • 2016-2019 : Membre élue du CAC et du CAC restreint de l’université de la rochelle
Implication dans des groupes de scientifiques :
  • 2015-2019 et 2019-2023 : Membre du GDR GRET « réseaux trophiques » puis membre du conseil scientifique du GDR et responsable d’un axe « écologie microbienne »
  • 2017-2022 : Membre du groupe Acclimaterra (Région Nouvelle-Aquitaine) puis depuis 2020 : participation à un réseau de recherche de la région Nouvelle-Aquitaine Futurs-Act : Anticipation au Changement climatique dans les Territoires en transition en Nouvelle-Aquitaine et ailleurs
  • 2019-2023 : Membre du CS de l’IR ILICO (anciennement RESOMAR)
  • 2022-2024 : membre de l’instance de gouvernance du réseau régional de la region Nouvelle-Aquitaine NAIADES (Réseau Régional de Recherche sur l’Eau)

Thèmes de Recherche.
Les travaux de recherche ont pour fil conducteur l’écologie microbienne/écologie trophique, plus particulièrement l’étude des protistes hétérotrophes, leur importance et leur rôle dans les écosystèmes côtiers anthropisés (marais, zone intertidale, baie) dans le pélagos et le benthos. J’étudie donc l’ensemble du réseau trophique et particulièrement le lien qu’ont les protistes hétérotrophes avec les autres compartiments (bactéries, nanoflagellés comme proies et mésozooplancton, huîtres, poissons, méiofaune comme prédateurs). J’ai élargi mon champ de compétences sur le lien entre les bas niveaux trophiques (producteurs primaires, protistes hétérotrophes, procaryotes hétérotrophes) et les consommateurs. Actuellement, mes travaux sur le plancton se focalisent sur la relation mésozooplancton–petits poissons pélagiques (relation proie-prédateur dans le Golfe de Gascogne), et sur les marais de Charente-Maritime avec la mise en place d’indicateurs de qualité des eaux à travers l’étude du réseau trophique planctonique. J’étudie aussi le rôle du plancton dans les fonctions carbone (puits/source), épuratrice et nourricerie des marais de Charente-Maritime et l’effet d’une submersion marine sur ces fonctions. Actuellement, mes travaux sur le benthos et sur le couplage benthos-pelagos portent les marais littoraux de Charente-Maritime : contribution du compartiment sédimentaire à la capacité épuratrice des eaux de surface, en étudiant la dynamique de la production primaire planctonique et de l’importance du couplage benthos-pelagos dans les différentes typologies de marais (doux, salés).

Mes compétences m’ont permis d’orienter mes recherches vers le carbone bleu. Le carbone bleu peut être utilisé pour atténuer les émissions de gaz à effet de serre en réduisant les émissions de dioxyde de carbone (et de méthane) et en augmentant la capacité de stockage de carbone dans les écosystèmes aquatiques.
Un cilié planctonique : Strombidium sp.
Responsabilités en Enseignement :

– Responsable de 4 UE (unités d’enseignements) en licence et master à l’Université de La Rochelle (2001-présent)
– Responsable de deux Diplômes Universitaires de Biologie et Ecologie sous-marine (BIOSOUM et BIOEM) (2020-présent)

Mots clés Enseignement :
Ecologie marine, dynamique des communautés, biologie des protistes, écologie microbienne, microbiologie, algologie, biologie animale et végétale, biologie sous-marine (3 formations existantes en France).

Publications et congrès
  • 135 publications à comité de lecture (rang A), H index : 37, nombre de citations : 3900 (selon Google scholar le 24 février 2025) et plus de 350 citations/an sur les trois dernières années.
  • Plus de 150 participations à des congrès internationaux et nationaux

Liste des publications :