Mauger Stéphane

Ingénieur d’Études
CNRS

Mots clés : Terrain, Bio-informatique, Marqueurs moléculaire, Microsatellites, SNP’s, Identification d’espèces, Assignation de parenté, QTL’s, Diversité génétique, Génétique/Génomique des populations.

Fonction : Ingénieur d’études en techniques d’écologie moléculaire et de génomique des populations
Fonction particulière : Sauveteur Secouriste du Travail
Plateau technique de rattachement : Plateforme Biologie Moléculaire

Avant l’intégration au LIENSs :

2008 - 2023 : Ingénieur d’Études en Biologie moléculaire au CNRS, Station Biologique de Roscoff (29)
IRL 3614 - Evolutionary Biology and Ecology of Algae, Etude de la structure génétique et phylogéographique de macro algues marines. Recherche de QTLs, cartographie génétique, caractérisation moléculaire des ressources génétiques.

2007 - 2008 : Technicien en Biologie moléculaire à l’INRA, Ploudaniel (29)
Laboratoire Amélioration des Plantes et Biotechnologies Végétales – Équipe Pomme de terre. Recherche de QTLs, cartographie génétique. Caractérisation moléculaire des ressources génétiques (pomme de terre).

1999 - 2007 : Technicien en Biologie moléculaire à l’INRA, Jouy-en-Josas (78)
Laboratoire Génétique des Poissons – Équipe Amélioration Génétique. Recherche de QTLs, cartographie génétique, assignation de parenté (truite, bars, carpe), entretien de souche (truite).

1997 - 1999 : Technicien en Biologie moléculaire à l’INRA, Jouy-en-Josas (78)
Laboratoire Génétique Microbienne – Équipe Analyses des Génomes. Séquençage du génome d’une bactérie lactique (Lactococcus lactis).

Nouvellement arrivé dans l’Unité, je souhaite mettre à profit mes 25 années d’expérience en Biologie Moléculaire au service des équipes du LIENSs. Mes domaines d’expertises sont l’assignation de parenté, l’identification d’espèces, la génétique et la génomique des populations à l’aide de marqueurs moléculaire de type microsatellites et SNP’s.

Liste des publications :

47 résultats

2023

Article dans une revue

The Rhodoexplorer Platform for Red Algal Genomics and Whole-Genome Assemblies for Several Gracilaria Species
Agnieszka P Lipinska , Stacy A Krueger-Hadfield , Olivier Godfroy , Simon M Dittami , Lígia Ayres-Ostrock , Guido Bonthond , Loraine Brillet-Guéguen , Susana Coelho , Erwan Corre , Guillaume Cossard , Christophe Destombe , Paul Epperlein , Sylvain Faugeron , Elizabeth Ficko-Blean , Jessica Beltrán , Emma Lavaut , Arthur Le Bars , Fabiana Marchi , Stéphane Mauger , Gurvan Michel , Philippe Potin , Delphine Scornet , Erik E Sotka , Florian Weinberger , Mariana Cabral de Oliveira , Marie-Laure Guillemin , Estela M Plastino , Myriam Valero
Genome Biology and Evolution, 2023, 15 (7), pp.evad124. ⟨10.1093/gbe/evad124⟩
Workflow for SNP genotyping using the Hi-Plex method v2
Anne-Laure Besnard , Anne- Laure Besnard , Daniel J Park , Bernard J Pope , Fleur Hammet , Sophie Michon- Coudouel , Marine Biget , Stacy A Krueger-Hadfield , Stéphane Mauger , Eric J Petit
Genetic resources of macroalgae: Development of an efficient method using microsatellite markers in non-model organisms
Stéphane Mauger , Aurélien Baud , Gildas Le Corguillé , Gwenn Tanguy , Erwan Legeay , Emeline Creis , Myriam Valero , Philippe Potin , Christophe Destombe
Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2023, 75, pp.103251. ⟨10.1016/j.algal.2023.103251⟩

2022

Article dans une revue

Pre‐domestication bottlenecks of the cultivated seaweed gracilaria chilensis
Oscar R Huanel , Suany Quesada-Calderón , Cristian Ríos , Sarai Morales-González , Pablo Saenz‐agudelo , Wendy A Nelson , Natalia Arakaki , Stéphane Mauger , Sylvain Faugeron , Marie‐laure Guillemin
Molecular Ecology, In press, ⟨10.1111/mec.16672⟩

2021

Article dans une revue

Population Genomics and Lagrangian Modeling Shed Light on Dispersal Events in the Mediterranean Endemic Ericaria zosteroides (=Cystoseira zosteroides) (Fucales)
Lauric Reynes , Didier Aurelle , Cristele Chevalier , Christel Pinazo , Myriam Valero , Stéphane Mauger , Stéphane Sartoretto , A. Blanfuné , Sandrine Ruitton , Charles F. Boudouresque , Marc Verlaque , Thierry Thibaut
Frontiers in Marine Science, 2021, 8, ⟨10.3389/fmars.2021.683528⟩
Development of tools to rapidly identify cryptic species and characterize their genetic diversity in different European kelp species
Stéphane Mauger , Louise Fouqueau , Komlan Avia , Lauric Reynes , Ester A Serrao , João Neiva , Myriam Valero
Journal of Applied Phycology, 2021, 33 (6), pp.4169 - 4186. ⟨10.1007/s10811-021-02613-x⟩
Genomic signatures of clonality in the deep water kelp Laminaria rodriguezii Genomic signatures of clonality
Lauric Reynes , Thierry Thibaut , Stéphane Mauger , Aurelie Blanfuné , Florian Holon , Corinne Cruaud , Arnaud Couloux , Myriam Valero , Didier Aurelle
Molecular Ecology, 2021, ⟨10.1111/mec.15860⟩

2020

Article dans une revue

Seascape Genomics of the Sugar Kelp Saccharina latissima Along the North Eastern Atlantic Latitudinal Gradient
Jaromir Guzinski , Paolo Ruggeri , Marion Ballenghien , Stéphane Mauger , Bertrand Jacquemin , Chloe Jollivet , Jérôme Coudret , Lucie Jaugeon , Christophe Destombe , Myriam Valero
Genes, 2020, 11 (12), pp.1503. ⟨10.3390/genes11121503⟩
After a catastrophe, a little bit of sex is better than nothing: Genetic consequences of a major earthquake on asexual and sexual populations
Ronan Becheler , Marie-Laure Guillemin , Solenn Stoeckel , Stéphane Mauger , Alice Saunier , Antonio Brante , Christophe Destombe , Myriam Valero
Evolutionary Applications, 2020, 13 (8), pp.2086- 2100. ⟨10.1111/EVA.12967⟩
Genetic structure of amphi-Atlantic Laminaria digitata (Laminariales, Phaeophyceae) reveals a unique range-edge gene pool and suggests post- glacial colonization of the NW Atlantic
João Neiva , Ester A Serrão , Cristina Paulino , Licinia Gouveia , Andrew Want , Éric Tamigneaux , Marion Ballenghien , Stéphane Mauger , Louise Fouqueau , Carolyn Engel-Gautier , Christophe Destombe , Myriam Valero
European Journal of Phycology, 2020, pp.1-12. ⟨10.1080/09670262.2020.1750058⟩
Better off alone? Compared performance of monoclonal and polyclonal stands of a cultivated red alga growth
José Luis Kappes , Marie Laure Guillemin , Sara Usandizaga , Alejandro H Buschmann , Carolina Camus , Sophie Arnaud-Haond , Stéphane Mauger , Myriam Valero
Evolutionary Applications, In press, ⟨10.1111/eva.12908⟩
Genetic diversity of a marine foundation species, Laminaria hyperborea (Gunnerus) Foslie, along the coast of Ireland
Kathryn M Schoenrock , Aisha M O'Connor , Stéphane Mauger , Myriam Valero , João Neiva , Ester A. Serrao , Stacy A Krueger-Hadfield
European Journal of Phycology, In press, ⟨10.1080/09670262.2020.1724338⟩
COMPARATIVE PHYLOGEOGRAPHY OF TWO AGAROPHYTON SPECIES IN THE NEW ZEALAND ARCHIPELAGO
Oscar R Huanel , Wendy A Nelson , Vanessa Robitzch , Stéphane Mauger , Sylvain Faugeron , Maren Preuss , Giuseppe Zuccarello , Marie-Laure Guillemin
Journal of Phycology, In press, ⟨10.1111/jpy.13046⟩

2019

Article dans une revue

Stranded alone: The first reported Peruvian population of Agarophyton chilensis is a single-male's clone
Vanessa Robitzch , Natalia Arakaki , Stéphane Mauger , José Carlos Zapata Rojas , Marie-Laure Guillemin
Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2019, 41 (Août 2019), pp.101527. ⟨10.1016/j.algal.2019.101527⟩
Dual influence of terrestrial and marine historical processes on the phylogeography of the Brazilian intertidal red alga Gracilaria caudata
Lígia Ayres-Ostrock , Myriam Valero , Stéphane Mauger , Mariana C Oliveira , Estela M Plastino , Marie-Laure Guillemin , Christophe Destombe
European Journal of Phycology, In press, ⟨10.1111/jpy.12892⟩
Genetic variability and transgenerational regulation of investment in sex in the monogonont rotifer Brachionus plicatilis
Océane Seudre , Eloïse Vanhoenacker , Stéphane Mauger , Jérôme Coudret , Denis Roze
Journal of Evolutionary Biology, In press, ⟨10.1111/jeb.13554⟩

Communication dans un congrès

GENetic diversity exploitation of Saccharina latissima for Innovative macro-ALGal biorefinery in Europe
Philippe Potin , Zofia Nehr , Paolo Ruggeri , Komlan Avia , Stéphane Mauger , Bertrand Jacquemin , Émilie Gouhier , Delphine Scornet , Jérôme Coudret , Stéphane Loisel , Susana M. Coelho , Christophe Destombe , Myriam Valero , J. Mark Cock
23rd International Seaweed Symposium, Apr 2019, Jeju, South Korea
Genetic Tools For The Development Of Improved Cultivars Of Saccharina latissima
Zofia Nehr , Komlan Avia , Stéphane Mauger , Bertrand Jacquemin , Émilie Gouhier , Delphine Scornet , Jérôme Coudret , Stéphane Loisel , Susana M. Coelho , Christophe Destombe , Myriam Valero , J. Mark Cock
23rd International Seaweed Symposium, Apr 2019, Jeju, North Korea

2017

Article dans une revue

High-density genetic map and identification of QTLs for responses to temperature and salinity stresses in the model brown alga Ectocarpus
Komlan Avia , Susana Coelho , Gabriel J Montecinos , Alexandre Cormier , Fiona Lerck , Stéphane Mauger , Sylvain Faugeron , Myriam Valero , J. Mark Cock , Pierre Boudry
Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp.43241. ⟨10.1038/srep43241⟩

Communication dans un congrès

QTL mapping in the model brown alga Ectocarpus
Komlan Avia , Susana M. Coelho , Gabriel J Montecinos , Alexandre Cormier , Fiona Lerck , Stéphane Mauger , Sylvain Faugeron , Myriam Valero , J. Mark Cock , Pierre Boudry P
8th annual meeting EFOR network, session " Genomic, evolution and adaptation", May 2017, Paris, France

2016

Article dans une revue

Patterns of genetic diversity of the cryptogenic red alga Polysiphonia morrowii (Ceramiales, Rhodophyta) suggest multiple origins of the Atlantic populations
Alexandre Geoffroy , Christophe Destombe , Byeongseok Kim , Stéphane Mauger , Paula Raffo , Myung Sook Kim , Line Le Gall
Ecology and Evolution, 2016, ⟨10.1002/ece3.2135⟩
Characterization of newly developed expressed sequence tag-derived microsatellite markers revealed low genetic diversity within and low connectivity between European Saccharina latissima populations
Jaromir Guzinski , Stéphane Mauger , J. Mark Cock , Myriam Valero
Journal of Applied Phycology, 2016, 28 (5), pp.3057-3070. ⟨10.1007/s10811-016-0806-7⟩

2015

Article dans une revue

How complementary barcoding and population genetics analyses can help solve taxonomic questions at short phylogenetic distances: the example of the brown alga Pylaiella littoralis
Christophe Destombe , Alexandre Geoffroy , Line Le Gall , Stéphane Mauger , Myriam Valero
European Journal of Phycology, 2015, 50 (sup1), pp.22
Keynote and Oral Papers
Christophe Destombe , Alexandre Geoffroy , Line Le Gall , Stéphane Mauger , Myriam Valero
European Journal of Phycology, 2015, 50 (sup1), pp.22-120. ⟨10.1080/09670262.2015.1069489⟩
Evolution and maintenance of haploid-diploid life cycles in natural populations: the case of the marine brown alga Ectocarpus
Lucia Couceiro , Mickael Le Gac , Heather M. Hunsperger , Stéphane Mauger , Christophe Destombe , J. Mark Cock , Sophia Ahmed , Susana M Coelho , Myriam Valero , Akira F Peters
Evolution - International Journal of Organic Evolution, 2015, 69 (7), pp.1808-1822. ⟨10.1111/evo.12702⟩
Molecular evidence for the coexistence of two sibling species in Pylaiella littoralis (Ectocarpales, Phaeophyceae) along the Brittany coast
Alexandre Geoffroy , Stéphane Mauger , Aurélien de Jode , Line Le Gall , Christophe Destombe
Journal of Phycology, 2015, 51 (3), pp.480-489 ⟨10.1111/jpy.12291⟩
Development and characterization of microsatellite markers in two agarophyte species Gracilaria birdiae and G. caudata (Gracilariaceae, Rhodophyta) using next-generation sequencing
Ligia M. Ayres-Ostrock , Stéphane Mauger , Estela Maria Plastino , Mariana C. Oliveira , Myriam Valero , Christophe Destombe
Journal of Applied Phycology, 2015, 28 (1), pp.1573-5176. ⟨10.1007/s10811-015-0592-7⟩

Communication dans un congrès

QTL mapping of stress related traits in Ectocarpus
Komlan Avia , Susana M. Coelho , Gabriel J Montecinos , Alexandre Cormier , Fiona Lerck , Stéphane Mauger , Sylvain Faugeron , Myriam Valero , J. Mark Cock , Pierre Boudry
5th annual meeting of the GDR MarCo « Marine Connectivity », Oct 2015, Montpellier, France
QTL mapping of stress related traits in the model brown alga Ectocarpus sp
Komlan Avia , Susana M. Coelho , Gabriel J Montecinos , Alexandre Cormier , Fiona Lerck , Stéphane Mauger , Sylvain Faugeron , Myriam Valero , J. Mark Cock , Pierre Boudry
Journées phycologiques de la société phycologique de France, Sep 2015, Vannes, France

2014

Article dans une revue

Alteration of Sexual Reproduction and Genetic Diversity in the Kelp Species Laminaria digitata at the Southern Limit of Its Range
Luz Valeria Oppliger , Peter von Dassow , Sarah Bouchemousse , Marine Robuchon , Myriam Valero , Juan A. Correa , Stéphane Mauger , Christophe Destombe
PLoS ONE, 2014, 9 (7), pp.e102518. ⟨10.1371/journal.pone.0102518⟩
Contrasting genetic diversity patterns in two sister kelp species co-distributed along the coast of Brittany, France
Marine Robuchon , Line Le Gall , Stéphane Mauger , Myriam Valero
Molecular Ecology, 2014, 23 (11), pp.2669-2685. ⟨10.1111/mec.12774⟩
Spatiotemporal changes in the genetic diversity of harmful algal blooms caused by the toxic dinoflagellate Alexandrium minutum
Aliou Dia , Laure Guillou , Stéphane Mauger , Estelle Bigeard , Dominique Marie , Myriam Valero , Christophe Destombe
Molecular Ecology, 2014, 23 (3), pp.549-560. ⟨10.1111/mec.12617⟩

Communication dans un congrès

Comparaison des patrons de diversité génétique entre deux espèces soeurs de laminaires le long du littoral breton
Marine Robuchon , Line Le Gall , Stéphane Mauger , Myriam Valero
Quatrième réunion du GDR MarCo, Jun 2014, Sète, France

2013

Article dans une revue

Resistance to a Rhabdovirus (VHSV) in Rainbow Trout: Identification of a Major QTL Related to Innate Mechanisms
Eloi R Verrier , Michel Dorson , Stéphane Mauger , Corinne Torhy , Céline Ciobotaru , Caroline Hervet , Nicolas Dechamp , Carine Genet , Pierre Boudinot , Edwige Quillet
PLoS ONE, 2013, 8 (2), pp.e55302. ⟨10.1371/journal.pone.0055302⟩
Evidences for the existence of two cryptic species in the Pylaiella littoralis complex(Ectocarpales, Phaeophyceae)
Christophe Destombe , Alexandre Geoffroy , Stéphane Mauger , Line Le Gall , Myriam Valero
Phycologia, 2013, 52 (Issue sup4), pp.24-25

2012

Article dans une revue

A Simple and Cost-Effective Method to Synthesize an Internal Size Standard Amenable to Use with a 5-Dye System
Stéphane Mauger , L Couceiro , M Valero
Prime Research on Biotechnology (PRB), 2012, 2 (3), pp.40-46

Communication dans un congrès

Gynogenetic clonal lines of rainbow trout[i] O. mykiss[/i], a model for the identification of new antiviral pathways
Eloi Verrier , Michel Dorson , Christelle Langevin , Nicolas Dechamp , Corinne Torhy , Stéphane Mauger , Sandrine Le Guillou , Céline Ciobotaru , Carine Genet , Pierre Boudinot , Edwige Quillet
11th Annual Meeting of the Complex Trait Community, Jun 2012, Paris, France

2011

Article dans une revue

MICROSATELLITE DEVELOPMENT IN RHODOPHYTA USING HIGH-THROUGHPUT SEQUENCE DATA
Lucía Couceiro , Isabel Maneiro , Stéphane Mauger , Myriam Valero , José Miguel Ruiz , Rodolfo Barreiro
Journal of Phycology, 2011, 47 (6), pp.1258-1265. ⟨10.1111/j.1529-8817.2011.01075.x⟩
Using genetic tools for sustainable management of kelps: a literature review and the example of Laminaria digitata
Myriam Valero , Christophe Destombe , Stéphane Mauger , Cecile Ribout , Carolyn R. Engel , Claire Daguin-Thiébaut , Florence Tellier
Cahiers de Biologie Marine, 2011, 52 (4, SI), pp.467-483

2010

Article dans une revue

Side effects of sexual maturation on heritability estimates in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
Mathilde Dupont-Nivet , Bernard Chevassus-Au-Louis , Stéphane Mauger , Pierrick Haffray , Marc Vandeputte
Aquaculture Research, 2010, 41 (11), pp.e878-e880. ⟨10.1111/j.1365-2109.2009.02448.x⟩

2008

Article dans une revue

Genetic variation for growth at one and two summers of age in the common carp (Cyprinus carpio L.): Heritability estimates and response to selection
Marc Vandeputte , Martin Kocour , Stéphane Mauger , Marek Rodina , Amandine Launay , David Gela , Mathilde Dupont-Nivet , Martin Hulak , Otomar Linhart
Aquaculture, 2008, 277 (1-2), pp.7-13. ⟨10.1016/j.aquaculture.2008.02.009⟩

Communication dans un congrès

Analyse génétique de la résistance à un rhabdovirus chez la truite arc-en-ciel
Edwige Quillet , Carine Genet , Francine Krieg , Amandine Launay , Sandrine Le Guillou , Stéphane Mauger , Kamila Canale-Tabet , Pierre Boudinot , Patrick Prunet
Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau, France

2007

Article dans une revue

Heritability estimates for processing and quality traits in common carp (Cyprinus carpio L.) using a molecular pedigree
Martin Kocour , Stéphane Mauger , Marek Rodina , David Gela , Otomar Linhart , Marc Vandeputte
Aquaculture, 2007, 270 (1-4), pp.43-50. ⟨10.1016/j.aquaculture.2007.03.001⟩

2006

Article dans une revue

A Type I and Type II microsatellite linkage map of Rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) with presumptive coverage of all chromosome arms
René Guyomard , Stéphane Mauger , Kamila Tabet-Canale , Sylvain Martineau , Carine Genet , Francine Krieg , Edwige Quillet
BMC Genomics, 2006, 7 (1), pp.302. ⟨10.1186/1471-2164-7-302⟩

2004

Article dans une revue

Heritability estimates for growth-related traits using microsatellite parentage assignment in juvenile common carp (Cyprinus carpio L.)
Marc Vandeputte , Martin Kocour , Stéphane Mauger , Mathilde Dupont-Nivet , Daphné de Guerry , Marek Rodina , David Gela , Dominique Vallod , Bernard Chevassus , Otomar Linhart
Aquaculture, 2004, 235 (1-4), pp.223-236. ⟨10.1016/j.aquaculture.2003.12.019⟩

2001

Article dans une revue

The Complete Genome Sequence of the Lactic Acid Bacterium Lactococcus lactis ssp. lactis IL1403
Alexander Bolotin , Patrick Wincker , Stéphane Mauger , Olivier Jaillon , Karine Malarme , Jean Weissenbach , S Dusko Ehrlich , Alexei Sorokin
Genome Research, 2001, 11 (5), pp.731-753. ⟨10.1101/gr.gr-1697r⟩

1999

Article dans une revue

Low-redundancy sequencing of the entire Lactococcus lactis IL1403 genome.
Alexander Bolotin , Stéphane Mauger , Karine Malarme , S. Dusko Ehrlich , Alexei Sorokin
Antonie van Leeuwenhoek, 1999, 76 (1-4), pp.27-76. ⟨10.1023/a:1002048720611⟩