LIttoral ENvironnement et Sociétés (LIENSs) - UMR 7266

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Post-doctorat 2011/2013
Ph.D. 2006-2011, Environmental and Evolutionary Biology, University of Louisiana at Lafayette (USA)

Formation d’origine :
MS Marine Biology, College of Charleston, SC (USA) ; BS Marine Biology, College of Charleston, SC (USA)

Directeur de thèse :
Scott C. France
Responsable scientifiques du post-doctorat :

  • Pascale Garcia, Enseignant-chercheur, Professeur, Université de La Rochelle

Financement du post-doctorat :
Financement du post-doctorat :
Contrat Projet Etat-Région (CPER), Projet ANR Hi-Flo et HySea


Bases génétiques du potentiel adaptatif de Macoma balthica
L’analyse et la compréhension des mécanismes adaptatifs des organismes marins sont aujourd’hui essentiels dans un contexte environnemental anthropisé, fragmenté et soumis à un changement climatique dont la rapidité est sans précédent. En écologie, pour appréhender les processus d’adaptation locale, l’étude des zones de contact entre taxons proches est une approche privilégiée, puisque dans ces régions vont se mettre en place des processus d’isolement reproducteur limitant les échanges génétiques et susceptibles d’aboutir à la spéciation. Ainsi, ces zones d’hybridation se maintiennent par des états de maladaptation des génotypes hybrides liée à des incompatibilités génétiques endogènes ou exogènes. En générant de nouvelles solutions évolutives par la mise en commun de fonds génétiques plus ou moins différenciés, en conférant une valeur adaptative aux hybrides dans des habitats particuliers susceptibles même d’aboutir à l’émergence de nouvelles espèces, les zones hybrides se placent au cœur de l’étude des mécanismes qui génèrent et maintiennent la biodiversité. Leur surveillance et leur protection sont donc d’un intérêt fondamental en terme de conservation.

Dans ce contexte, le bivalve Macoma balthica s’impose comme modèle d’étude. Cette espèce, qui peuple les milieux sablo-vaseux intertidaux et subtidaux de l’ensemble des littoraux de l’hémisphère nord, occupe une place stratégique dans le réseau trophique, et semble être d’ores et déjà affectée par les changements globaux contemporains puisque son aire de répartition se rétracte vers le Nord en parallèle du réchauffement des eaux de surface dans le golfe de Gascogne. Ainsi, autrefois située en Espagne, la limite sud de l’aire de répartition se trouve désormais dans l’estuaire de la Gironde. Nos travaux ont récemment mis en évidence que cette zone est à la confluence de différents stocks génétiques, ce qui présuppose la mise en place d’une zone hybride. M. balthica nous offre donc une opportunité unique d’étudier l’évolution d’une zone hybride en temps réel dans un contexte de changement climatique.

Résultats des analyses Bayésiennes de regroupement de populations de Macoma balthica faits à partir de données nucléaires (gauche) et mitochondriales (droite). Les échelles à droite montrent les proportions d’appartenance à un ancètre commun (ou niveaux d’admixture) pour chaque groupe. Source : Becquet , Simon-Bouhet , Pante, Hummel et Garcia, 2012

Principales collaborations :
- Nicolas Bierne, ISEM, U Montpellier II
- Phil Dustan, College of Charleston, USA
- Scott France, U Louisiana at Lafayette, USA
- Derek Johnson, Virginia Commonwealth U, USA
- Sarah Samadi, IRD / MNHN, Paris
- Les Watling, U Hawaii, USA

Liste des publications :
* Cette liste est une extraction automatique des publications référencées sous HAL qui est susceptible de contenir des doublons. Ces derniers sont en cours d’analyse et seront supprimés prochainement.

20 résultats

2017

Article dans une revue

Putative sex-linked heteroplasmy in the tellinid bivalve Limecola balthica (Linnaeus, 1758)
Eric Pante , Camille Poitrimol , Alice Saunier , Vanessa Becquet , Pascale Garcia
Journal of Molluscan Studies, Oxford University Press (OUP), 2017, 83 (2), pp. 226-228. 〈https://academic.oup.com/mollus/article-abstract/83/2/226/2758300?redirectedFrom=fulltext〉. 〈10.1093/mollus/eyw038〉
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2016

Article dans une revue

Short-Term and Long-Term Biological Effects of Chronic Chemical Contamination on Natural Populations of a Marine Bivalve
Marine Breitwieser , Amélia Viricel , Marianne Graber , Laurence Murillo , Vanessa Becquet , Carine Churlaud , Ingrid Fruitier-Arnaudin , Valérie Huet , Camille Lacroix , Eric Pante , Stéphane Le Floch , Hélène Thomas-Guyon
PLoS ONE, Public Library of Science, 2016, 11, pp.150184 - 150184. 〈10.1371/journal.pone.0150184〉
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Nomenclatural note on the homonymy between the octocoral genus Dendrobrachia Brook 1889 and the entoproct phylum Dendrobrachia Xian-Guan, Bergström, Xio-Ya and Jie 2006
Eric Pante
Zootaxa, Magnolia Press, 2016, 4107 (4), pp.598-598. 〈http://www.mapress.com/j/zt/article/view/zootaxa.4107.4.8〉. 〈10.11646/zootaxa.4107.4.8〉
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2015

Article dans une revue

Patchiness of deep-sea communities in Papua New Guinea and potential susceptibility to anthropogenic disturbances illustrated by seep organisms
Sarah Samadi , Nicolas Puillandre , Eric Pante , Marie-Catherine Boisselier , Wei-Jen Chen , Laure Corbari , Philippe Maestrati , Ralph Mana , Justine Thubaut , Dario Zuccon , Stéphane Hourdez
Marine Ecology, Wiley, 2015, Special Issue: Biological and Ecological Processes in Reducing Marine Environments: Proceedings of the 5th International Symposium on Chemosynthesis-Based Ecosystems, 36 (Issue Supplement S1), pp.109-132. 〈10.1111/maec.12204〉
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Genetic monitoring of pilot whales, Globicephala spp. (Cetacea: Delphinidae), stranded on French coasts
Etienne Sabatier , Eric Pante , Claire Dussud , Olivier Van Canneyt , Benoit Simon-Bouhet , Amélia Viricel
Mammalia, De Gruyter, 2015, 79 (1), pp.111-114. 〈http://www.degruyter.com/view/j/mamm.2015.79.issue-1/mammalia-2013-0155/mammalia-2013-0155.xml?rskey=4FPL7w&result=1〉. 〈10.1515/mammalia-2013-0155〉
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An inter-ocean comparison of coral endemism on seamounts: the case of Chrysogorgia
Eric Pante , Scott France , Delphine Gey , Corinne Cruaud , Sarah Samadi
Journal of Biogeography, Wiley, 2015, 42 (10), pp.1907-1918. 〈http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/jbi.12564/abstract〉. 〈10.1111/jbi.12564〉
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Species are hypotheses: avoid connectivity assessments based on pillars of sand
Eric Pante , Nicolas Puillandre , Amélia Viricel , Sophie Arnaud-Haond , Didier Aurelle , Magalie Castelin , Anne Chenuil , Christophe Destombe , Didier Forcioli , Myriam Valero , Frédérique Viard , Sarah Samadi
Molecular Ecology, Wiley, 2015, 24 (3), pp.525-544. 〈10.1111/mec.13048〉
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Communication dans un congrès

Use of integrative taxonomy and DNA barcoding for characterization of ecological processes structuring marine benthic community assemblages in British Columbia
Magalie Castelin , Niels Van Steenkiste , Scott Gilmore , Eric Pante , Rick Harbo , Geoff Lowe , Bill Merilees , Melissa Frey , Thomas Therriault , Cathryn Abbott
6th International Barcode of Life Conference, Aug 2015, Guelph, Canada. 58 (5), pp.204, 2015, Scientific abstracts from the 6th International Barcode of Life Conference / Résumés scientifiques du 6e congrès international « Barcode of Life ». 〈10.1139/gen-2015-0087〉
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2014

Article dans une revue

Mitochondrial genomes of the Baltic clam Macoma balthica (Bivalvia: Tellinidae): setting the stage for studying mito-nuclear incompatibilities
Alice Saunier , Pascale Garcia , Vanessa Becquet , Nathalie Marsaud , Frédéric Escudié , Eric Pante
BMC Evolutionary Biology, BioMed Central, 2014, 14 (259), pp.1-13. 〈10.1186/s12862-014-0259-z〉
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Applicability of RAD-tag genotyping for inter-familial comparisons: empirical data from two cetaceans
Amélia Viricel , Eric Pante , Willy Dabin , Benoit Simon-Bouhet
Molecular Ecology Resources, Wiley/Blackwell, 2014, 14 (3), pp.597-605. 〈10.1111/1755-0998.12206〉
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2013

Article dans une revue

Molecular and morphological data support reclassification of the octocoral genus Isidoides
Eric Pante , Esprit Heestand-Saucier , Scott France
Invertebrate Systematics, CSIRO Publishing, 2013, 27, pp.365-378. 〈10.1071/IS12053〉
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Effects of fine-scale environmental heterogeneity on local genetic structure in Macoma balthica from the Gulf of Gdañsk (southern Baltic Sea)
Vanessa Becquet , Rafal Lasota , Eric Pante , Adam Sokolowski , Maciej Wolowicz , Pascale Garcia
Hydrobiologia, Kluwer Academic Publishers, 2013, 714 (1), pp.61-70. 〈10.1007/s10750-013-1530-9〉
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marmap: A Package for Importing, Plotting and Analyzing Bathymetric and Topographic Data in R
Eric Pante , Benoit Simon-Bouhet
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (9), pp.e73051. 〈10.1371/journal.pone.0073051〉
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2012

Article dans une revue

Exploration of the deep-sea fauna of Papua New Guinea
Eric Pante , Laure Corbari , Justine Thubaut , Tin-Yam Chan , Ralph Mana , Marie-Catherine Boisselier , Philippe Bouchet , Sarah Samadi
Oceanography, Oceanography Society, 2012, 25 (3), pp.214-225. 〈10.5670/oceanog.2012.65〉
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SNP Detection from De Novo Transcriptome Sequencing in the Bivalve Macoma balthica: Marker Development for Evolutionary Studies
Eric Pante , Audrey Rohfritsch , Vanessa Becquet , Khalid Belkhir , Nicolas Bierne , Pascale Garcia
PLoS ONE, Public Library of Science, 2012, 7 (12), pp.e52302. 〈10.1371/journal.pone.0052302〉
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Getting to the Point: Accuracy of Point Count in Monitoring Ecosystem Change
Eric Pante , Phil Dustan
Journal of Marine Biology, 2012, 2012, Article ID 802875, 7 p. 〈10.1155/2012/802875〉
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Chrysogorgia from the New England and Corner Seamounts: Atlantic – Pacific connections
Eric Pante , Les Watling
Journal of the Marine Biological Association of the UK (JMBA), 2012, 95 (5), pp.911-927. 〈http://journals.cambridge.org/action/displayAbstract?fromPage=online&aid=8641117〉. 〈10.1017/S0025315411001354〉
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Glacial refugium versus range limit: Conservation genetics of Macoma Balthica, a key species in the Bay of Biscay (France)
Vanessa Becquet , Benoit Simon-Bouhet , Eric Pante , Herman Hummel , Pascale Garcia
Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, Elsevier, 2012, 432-433, pp.73-82. 〈10.1016/j.jembe.2012.07.008〉
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2010

Article dans une revue

Pseudochrysogorgia bellona n. gen., n. sp.: a new genus and species of chrysogorgiid octocoral (Coelenterata, Anthozoa) from the Coral Sea
Eric Pante , Scott France
Zoosystema, Museum Nationale d'Histoire Naturelle Paris, 2010, pp.595-612. 〈http://www.mnhn.fr/fr/explorez/ressources-documentaires/publications-scientifiques-museum-national-histoire-naturelle?PUBLICATION_ID=2&idx=26&nav=publication〉. 〈10.5252/z2010n4a4〉
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2006

Article dans une revue

Spatial patterns of benthic invertebrate assemblages within atoll lagoons: importance of habitat heterogeneity and considerations for marine protected area design in French Polynesia
Eric Pante , Mehdi Adjeroud , Lucie Penin , Phil Dustan , Muriel Schrimm
Aquatic Living Resources, EDP Sciences, 2006, 19, pp.207-217. 〈10.1051/alr:2006021〉
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Articles de vulgarisation :

  • Pante E, France SC (2009) Randonnée au fond des océans : l’exploration des monts sous-marins. Le Courrier de la Nature 247 : 34-41
  • Viricel A and Pante E (2007) Utiliser la génétique pour mieux décrire, comprendre et protéger la nature. Le Courrier de la Nature 235 : 22-27

voir aussi :
Journal club de biologie moléculaire : un site d’échanges et de débats autour d’articles consacrés à la biologie moléculaire, initié par des chercheurs de LIENSs