Pante Eric
- Équipe de rattachement : AMARE
- Statut : Chercheur
- eric.pante*at*univ-lr.fr
- personnal web page
- Tél. : 05 16 49 65 43
Chercheur CNRS (CRCN)
Section de Recherche : Section 29
Institut référent : INEE
Mots clés : écologie évolutive, invertébrés marins
Bases génétiques du potentiel adaptatif de Macoma balthica
L’analyse et la compréhension des mécanismes adaptatifs des organismes marins sont aujourd’hui essentiels dans un contexte environnemental anthropisé, fragmenté et soumis à un changement climatique dont la rapidité est sans précédent. En écologie, pour appréhender les processus d’adaptation locale, l’étude des zones de contact entre taxons proches est une approche privilégiée, puisque dans ces régions vont se mettre en place des processus d’isolement reproducteur limitant les échanges génétiques et susceptibles d’aboutir à la spéciation. Ainsi, ces zones d’hybridation se maintiennent par des états de maladaptation des génotypes hybrides liée à des incompatibilités génétiques endogènes ou exogènes. En générant de nouvelles solutions évolutives par la mise en commun de fonds génétiques plus ou moins différenciés, en conférant une valeur adaptative aux hybrides dans des habitats particuliers susceptibles même d’aboutir à l’émergence de nouvelles espèces, les zones hybrides se placent au cœur de l’étude des mécanismes qui génèrent et maintiennent la biodiversité. Leur surveillance et leur protection sont donc d’un intérêt fondamental en terme de conservation.
Dans ce contexte, le bivalve Macoma balthica s’impose comme modèle d’étude. Cette espèce, qui peuple les milieux sablo-vaseux intertidaux et subtidaux de l’ensemble des littoraux de l’hémisphère nord, occupe une place stratégique dans le réseau trophique, et semble être d’ores et déjà affectée par les changements globaux contemporains puisque son aire de répartition se rétracte vers le Nord en parallèle du réchauffement des eaux de surface dans le golfe de Gascogne. Ainsi, autrefois située en Espagne, la limite sud de l’aire de répartition se trouve désormais dans l’estuaire de la Gironde. Nos travaux ont récemment mis en évidence que cette zone est à la confluence de différents stocks génétiques, ce qui présuppose la mise en place d’une zone hybride. M. balthica nous offre donc une opportunité unique d’étudier l’évolution d’une zone hybride en temps réel dans un contexte de changement climatique.
Résultats des analyses Bayésiennes de regroupement de populations de Macoma balthica faits à partir de données nucléaires (gauche) et mitochondriales (droite). Les échelles à droite montrent les proportions d’appartenance à un ancètre commun (ou niveaux d’admixture) pour chaque groupe. Source : Becquet , Simon-Bouhet , Pante, Hummel et Garcia, 2012
Principales collaborations :
Nicolas Bierne, ISEM, U Montpellier II
Phil Dustan, College of Charleston, USA
Scott France, U Louisiana at Lafayette, USA
Derek Johnson, Virginia Commonwealth U, USA
Sarah Samadi, IRD / MNHN, Paris
Les Watling, U Hawaii, USA
Liste des publications :
37 résultats
2021
Article dans une revue
Sea surface temperature, rather than land mass or geographic distance, may drive genetic differentiation in a species complex of highly-dispersive seabirds
Lucas Torres
,
Eric Pante
,
Jacob Gonz Lez Sol S
,
Amélia Viricel
,
Cecile Ribout
,
Frank Zino
,
Will Mackin
,
Carine Precheur
,
Julie Tourmetz
,
Licia Calabrese
,
Teresa Militão
,
Laura Zango
,
Hadoram Shirihai
,
Vincent Bretagnolle
Ecology and Evolution, Wiley Open Access, 2021, ⟨10.1002/ece3.8180⟩
Multiple genetic marker analysis challenges the introduction history of Ulva australis (Ulvales, Chlorophyta) on French coasts
Pierre-Guy Sauriau
,
Manon Dartois
,
Vanessa Becquet
,
Fabien Aubert
,
Valérie Huet
,
Martine Bréret
,
Amélia Viricel
,
Eric Pante
European Journal of Phycology, Taylor & Francis, 2021, 56 (4), pp.455-467. ⟨10.1080/09670262.2021.1876249⟩
Phylogenetic Relationships Within Chrysogorgia (Alcyonacea: Octocorallia), a Morphologically Diverse Genus of Octocoral, Revealed Using a Target Enrichment Approach
Candice Untiedt
,
Andrea Quattrini
,
Catherine Mcfadden
,
Phil Alderslade
,
Eric Pante
,
Christopher Burridge
Frontiers in Marine Science, Frontiers Media, 2021, 7, pp.1175. ⟨10.3389/fmars.2020.599984⟩
Molecular genetic diversity of seaweeds morphologically related to Ulva rigida at three sites along the French Atlantic coast
Manon Dartois
,
Eric Pante
,
Amelia Viricel
,
Vanessa Becquet
,
Pierre-Guy Sauriau
PeerJ, PeerJ, In press
2020
Article dans une revue
Editorial: Evolution of Mitochondrial Genomes
Sophie Breton
,
Eric Pante
,
Xiao-Feng Xue
,
Jing-Tao Sun
Frontiers in Ecology and Evolution, Frontiers Media S.A, 2020, Evolution of Mitochondrial Genomes, ⟨10.3389/fevo.2020.615233⟩
Unorthodox features in two venerid bivalves with doubly uniparental inheritance of mitochondria
Charlotte Capt
,
Karim Bouvet
,
Davide Guerra
,
Brent Robicheau
,
Donald Stewart
,
Eric Pante
,
Sophie Breton
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2020, 10 (1), ⟨10.1038/s41598-020-57975-y⟩
Data, time and money: evaluating the best compromise for inferring molecular phylogenies of non-model animal taxa
Paul Zaharias
,
Eric Pante
,
Delphine Gey
,
Alexander Fedosov
,
Nicolas Puillandre
Molecular Phylogenetics and Evolution, Elsevier, 2020, 142, pp.106660. ⟨10.1016/j.ympev.2019.106660⟩
Chapitre d'ouvrage
An unusual evolutionary strategy: the origins, genetic repertoire, and implications of doubly uniparental inheritance of mitochondrial DNA in bivalves
Donald Stewart
,
Sophie Breton
,
Emily Chase
,
Brent Robicheau
,
Stefano Bettinazzi
,
Eric Pante
,
Noor Youssef
,
Manuel Garrido-Ramos
Pontarotti P. Proceedings of the 24th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles, Springer, Cham, pp.301-323, 2020, Evolutionary Biology—A Transdisciplinary Approach, ⟨10.1007/978-3-030-57246-4_12⟩
2019
Article dans une revue
Investigation of the molecular signatures of selection on ATP synthase genes in the marine bivalve Limecola balthica
Eric Pante
,
Vanessa Becquet
,
Amélia Viricel
,
Pascale Garcia
Aquatic Living Resources, EDP Sciences, 2019, 32, pp.3. ⟨10.1051/alr/2019001⟩
Ocean warming combined with lower omega-3 nutritional availability impairs the cardio-respiratory function of a marine fish
Marie Vagner
,
Eric Pante
,
Amélia Viricel
,
Thomas Lacoue-Labarthe
,
Jose-Luis Zambonino-Infante
,
Patrick Quazuguel
,
Emmanuel Dubillot
,
Valérie Huet
,
Hervé Le Delliou
,
Christel Lefrançois
,
Nathalie Imbert-Auvray
Journal of Experimental Biology, Cambridge University Press, 2019, 222 (8), pp.jeb187179. ⟨10.1242/jeb.187179⟩
Evidence for a duplicated mitochondrial region in Audubon’s shearwater based on MinION sequencing
Lucas Torres
,
Andreanna Welch
,
Catherine Zanchetta
,
R. Terry Chesser
,
Maxime Manno
,
Cecile Donnadieu
,
Vincent Bretagnolle
,
Eric Pante
Mitochondrial DNA Part A, Taylor and Francis, 2019, 30 (2), pp.256-263. ⟨10.1080/24701394.2018.1484116⟩
Advances on the phylogenetic placement of the enigmatic octocoral Dendrobrachia Brook 1889
D. Aurelle
,
Eric Pante
,
Jean-Baptiste Ledoux
,
Stéphane Sartoretto
Zootaxa, Magnolia Press, 2019, 4674 (1), pp.117-126. ⟨10.11646/zootaxa.4674.1.6⟩
Communication dans un congrès
Ocean warming combined with lower omega-3 nutritional availability impairs thecardio-respiratory function of a marine fish
Marie Vagner
,
Eric Pante
,
Amelia Viricel
,
Thomas Lacoue-Labarthe
,
Jose-Luis Zambonino-Infante
,
Patrick Quazuguel
,
Emmanuel Dubillot
,
Valérie Huet
,
Hervé Le Delliou
,
Christel Lefrançois
,
Nathalie Imbert-Auvray
Colloque d'Ecophysiologie Animale, Oct 2019, Rennes, France
2018
Article dans une revue
De novo assembly and functional annotation of the transcriptome of Mimachlamys varia , a bioindicator marine bivalve
Amélia Viricel
,
Vanessa Becquet
,
Emmanuel Dubillot
,
Eric Pante
Marine Genomics, Elsevier, 2018, 41, pp.42-45. ⟨10.1016/j.margen.2018.04.002⟩
2017
Article dans une revue
Putative sex-linked heteroplasmy in the tellinid bivalve Limecola balthica (Linnaeus, 1758)
Eric Pante
,
Camille Poitrimol
,
Alice Saunier
,
Vanessa Becquet
,
Pascale Garcia
Journal of Molluscan Studies, Oxford University Press (OUP), 2017, 83 (2), pp. 226-228. ⟨10.1093/mollus/eyw038⟩
2016
Article dans une revue
Short-Term and Long-Term Biological Effects of Chronic Chemical Contamination on Natural Populations of a Marine Bivalve
Marine Breitwieser
,
Amélia Viricel
,
Marianne Graber
,
Laurence Murillo
,
Vanessa Becquet
,
Carine Churlaud
,
Ingrid Fruitier-Arnaudin
,
Valérie Huet
,
Camille Lacroix
,
Eric Pante
,
Stéphane Le Floch
,
Hélène Thomas-Guyon
PLoS ONE, Public Library of Science, 2016, 11, pp.150184 - 150184. ⟨10.1371/journal.pone.0150184⟩
Nomenclatural note on the homonymy between the octocoral genus Dendrobrachia Brook 1889 and the entoproct phylum Dendrobrachia Xian-Guan, Bergström, Xio-Ya and Jie 2006
Eric Pante
Zootaxa, Magnolia Press, 2016, 4107 (4), pp.598-598. ⟨10.11646/zootaxa.4107.4.8⟩
2015
Article dans une revue
Patchiness of deep-sea communities in Papua New Guinea and potential susceptibility to anthropogenic disturbances illustrated by seep organisms
Sarah Samadi
,
Nicolas Puillandre
,
Eric Pante
,
Marie-Catherine Boisselier
,
Wei-Jen Chen
,
Laure Corbari
,
Philippe Maestrati
,
Ralph Mana
,
Justine Thubaut
,
Dario Zuccon
,
Stéphane Hourdez
Marine Ecology, Wiley, 2015, Special Issue: Biological and Ecological Processes in Reducing Marine Environments: Proceedings of the 5th International Symposium on Chemosynthesis-Based Ecosystems, 36 (Issue Supplement S1), pp.109-132. ⟨10.1111/maec.12204⟩
Use of RAD sequencing for delimiting species
Eric Pante
,
Jawad Abdelkrim
,
Amélia Viricel
,
Delphine Gey
,
Scott France
,
Marie-Catherine Boisselier
,
Sarah Samadi
Heredity, Nature Publishing Group, 2015, 114, pp.450-459. ⟨10.1038/hdy.2014.105⟩
Species are hypotheses: avoid connectivity assessments based on pillars of sand
Eric Pante
,
Nicolas Puillandre
,
Amélia Viricel
,
Sophie Arnaud-Haond
,
D. Aurelle
,
Magalie Castelin
,
Anne Chenuil
,
Christophe Destombe
,
Didier Forcioli
,
Myriam Valero
,
Frédérique Viard
,
Sarah Samadi
Molecular Ecology, Wiley, 2015, 24 (3), pp.525-544
Genetic monitoring of pilot whales, Globicephala spp. (Cetacea: Delphinidae), stranded on French coasts
Etienne Sabatier
,
Eric Pante
,
Claire Dussud
,
Olivier Van Canneyt
,
Benoit Simon-Bouhet
,
Amélia Viricel
Mammalia, De Gruyter, 2015, 79 (1), pp.111-114. ⟨10.1515/mammalia-2013-0155⟩
Evaluating the genetic effects of the invasive Ocenebra inornata on the native oyster drill Ocenebra erinacea
Eric Pante
,
Pierre-Yves Pascal
,
Vanessa Becquet
,
Amélia Viricel
,
Benoit Simon-Bouhet
,
Pascale Garcia
Marine Ecology, Wiley, 2015, 36 (4), pp.1118-1128. ⟨10.1111/maec.12208⟩
An inter-ocean comparison of coral endemism on seamounts: the case of Chrysogorgia
Eric Pante
,
Scott France
,
Delphine Gey
,
Corinne Cruaud
,
Sarah Samadi
Journal of Biogeography, Wiley, 2015, 42 (10), pp.1907-1918. ⟨10.1111/jbi.12564⟩
From Integrative Taxonomy to Species Description: one Step Beyond
Eric Pante
,
Charlotte Schoelinck
,
Nicolas Puillandre
Systematic Biology, Oxford University Press (OUP), 2015, 64 (1), pp.152-160. ⟨10.1093/sysbio/syu083⟩
Communication dans un congrès
Use of integrative taxonomy and DNA barcoding for characterization of ecological processes structuring marine benthic community assemblages in British Columbia
Magalie Castelin
,
Niels Van Steenkiste
,
Scott Gilmore
,
Eric Pante
,
Rick Harbo
,
Geoff Lowe
,
Bill Merilees
,
Melissa Frey
,
Thomas Therriault
,
Cathryn Abbott
6th International Barcode of Life Conference, Aug 2015, Guelph, Canada. pp.204, ⟨10.1139/gen-2015-0087⟩
2014
Article dans une revue
Mitochondrial genomes of the Baltic clam Macoma balthica (Bivalvia: Tellinidae): setting the stage for studying mito-nuclear incompatibilities
Alice Saunier
,
Pascale Garcia
,
Vanessa Becquet
,
Nathalie Marsaud
,
Frédéric Escudié
,
Eric Pante
BMC Evolutionary Biology, BioMed Central, 2014, 14 (259), pp.1-13. ⟨10.1186/s12862-014-0259-z⟩
Applicability of RAD-tag genotyping for inter-familial comparisons: empirical data from two cetaceans
Amélia Viricel
,
Eric Pante
,
Willy Dabin
,
Benoit Simon-Bouhet
Molecular Ecology Resources, Wiley/Blackwell, 2014, 14 (3), pp.597-605. ⟨10.1111/1755-0998.12206⟩
2013
Article dans une revue
Molecular and morphological data support reclassification of the octocoral genus Isidoides
Eric Pante
,
Esprit Heestand-Saucier
,
Scott France
Invertebrate Systematics, CSIRO Publishing, 2013, 27, pp.365-378. ⟨10.1071/IS12053⟩
marmap: A Package for Importing, Plotting and Analyzing Bathymetric and Topographic Data in R
Eric Pante
,
Benoit Simon-Bouhet
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (9), pp.e73051. ⟨10.1371/journal.pone.0073051⟩
Effects of fine-scale environmental heterogeneity on local genetic structure in Macoma balthica from the Gulf of Gdañsk (southern Baltic Sea)
Vanessa Becquet
,
Rafal Lasota
,
Eric Pante
,
Adam Sokolowski
,
Maciej Wolowicz
,
Pascale Garcia
Hydrobiologia, Springer, 2013, 714 (1), pp.61-70. ⟨10.1007/s10750-013-1530-9⟩
2012
Article dans une revue
SNP Detection from De Novo Transcriptome Sequencing in the Bivalve Macoma balthica: Marker Development for Evolutionary Studies
Eric Pante
,
Audrey Rohfritsch
,
Vanessa Becquet
,
Khalid Belkhir
,
Nicolas Bierne
,
Pascale Garcia
PLoS ONE, Public Library of Science, 2012, 7 (12), pp.e52302. ⟨10.1371/journal.pone.0052302⟩
Getting to the Point: Accuracy of Point Count in Monitoring Ecosystem Change
Eric Pante
,
Phil Dustan
Journal of Marine Biology, Hindawi Publishing Corporation, 2012, 2012, Article ID 802875, 7 p. ⟨10.1155/2012/802875⟩
Exploration of the deep-sea fauna of Papua New Guinea
Eric Pante
,
Laure Corbari
,
Justine Thubaut
,
Tin-Yam Chan
,
Ralph Mana
,
Marie-Catherine Boisselier
,
Philippe Bouchet
,
Sarah Samadi
Oceanography, Oceanography Society, 2012, 25 (3), pp.214-225. ⟨10.5670/oceanog.2012.65⟩
Glacial refugium versus range limit: Conservation genetics of Macoma Balthica, a key species in the Bay of Biscay (France)
Vanessa Becquet
,
Benoit Simon-Bouhet
,
Eric Pante
,
Herman Hummel
,
Pascale Garcia
Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, Elsevier, 2012, 432-433, pp.73-82. ⟨10.1016/j.jembe.2012.07.008⟩
Chrysogorgia from the New England and Corner Seamounts: Atlantic – Pacific connections
Eric Pante
,
Les Watling
Journal of the Marine Biological Association of the UK (JMBA), 2012, 95 (5), pp.911-927. ⟨10.1017/S0025315411001354⟩
2010
Article dans une revue
Pseudochrysogorgia bellona n. gen., n. sp.: a new genus and species of chrysogorgiid octocoral (Coelenterata, Anthozoa) from the Coral Sea
Eric Pante
,
Scott France
Zoosystema, Museum Nationale d'Histoire Naturelle Paris, 2010, pp.595-612. ⟨10.5252/z2010n4a4⟩
2006
Article dans une revue
Spatial patterns of benthic invertebrate assemblages within atoll lagoons: importance of habitat heterogeneity and considerations for marine protected area design in French Polynesia
Eric Pante
,
Mehdi Adjeroud
,
Lucie Penin
,
Phil Dustan
,
Muriel Schrimm
Aquatic Living Resources, EDP Sciences, 2006, 19, pp.207-217. ⟨10.1051/alr:2006021⟩
Articles de vulgarisation :
- Pante E, France SC (2009) Randonnée au fond des océans : l’exploration des monts sous-marins. Le Courrier de la Nature 247 : 34-41
- Viricel A and Pante E (2007) Utiliser la génétique pour mieux décrire, comprendre et protéger la nature. Le Courrier de la Nature 235 : 22-27
voir aussi :
Journal club de biologie moléculaire : un site d’échanges et de débats autour d’articles consacrés à la biologie moléculaire, initié par des chercheurs de LIENSs