virus
LES VIRUS
Constitués de fragments d’acides nucléiques (ADN ou ARN) enveloppés par un manteau protéique appelé la capside, les virus sont considérés comme des entités biologiques acellulaires. Ils ont alors besoin d’une cellule hôte pour se multiplier et sont capables d’infecter tous les types d’organismes depuis les bactéries jusqu’à l’homme. Parasites obligatoires de cellules vivantes, ils ne nécessitent pas de ressources nutritives pour survivre, seulement de la machinerie métabolique de leur hôte. Leur taille est très faible, la plupart mesurent en moyenne entre 20 nm et 200 nm (sauf exception pour des virus géants de type Ebola, Mamavirus ou Mimivirus qui peuvent atteindre 1000 nm).
Les virus se rencontrent dans tous les écosystèmes terrestres et aquatiques sous deux formes : sous la forme extracellulaire, le virion est inerte et peut persister dans l’environnement assez longtemps en attendant de trouver un hôte spécifique. Sous la forme intracellulaire, le virus infecte un hôte et induit la synthèse de nouveaux virus par la cellule-hôte avant le déclenchement de sa lyse et la libération de nouveaux virions dans l’environnement.
LES VIRUS ETUDIES :
Les virus sont omniprésents dans les environnements aquatiques pélagiques et benthiques, où ils représentent l’entité biologique la plus abondante. Leur abondance varie généralement entre 107 et 108 particules.mL-1. En terme de biomasse carbonée, ils représentent le 2nd réservoir de biomasse dans les écosystèmes marins après les procaryotes.
Au sein de l’équipe BIOFEEL, les virus sont étudiés sous l’aspect Ecologie virale aquatique. Ainsi, l’ensemble de la communauté pélagique et benthique virale est étudiée, en particulier les interactions avec leur cellules hôtes (les bactéries principalement et mais aussi le phytoplancton) et ses conséquences sur le fonctionnement du réseau trophique.
Les infections virales sont essentielles dans différents processus écologiques en environnement aquatique, notamment les processus de perte des communautés microbiennes (lyses des archées, bactéries, phytoplancton…), la dynamique de la diversité des communautés hôtes et les cycles des éléments chimiques (azote, carbone, phosphore…). Ces processus sont à la base du fonctionnement des réseaux trophiques. Les virus agissent en court-circuitant le transfert de la matière vers les niveaux trophiques supérieurs, en réduisant les particules vivantes en matière organique dissoute et en accélérant les processus respiratoires.
LA RECHERCHE SUR LES VIRUS :
- Le rôle des virus planctoniques dans le fonctionnement du réseau microbien des écosystèmes littoraux est abordé par des approches in situ et expérimentales afin de caractériser (1) les interactions virus/flagellés dans la régulation du compartiment procaryotique (2) les relations entre la diversité virale et la diversité des procaryotes, en fonction (3) de l’état trophique du milieu, de l’apport de nutriments ou de microorganismes benthiques.
- Etude de l’impact des virus sur les diatomées et le rôle écologique de leurs interactions
LES CHERCHEURS CONCERNES :
Montanié Hélène, Martin-Jezequel Véronique
LES OUVRAGES DE REFERENCE :
- Manual of Aquatic Viral Ecology. S.W. Wilhelm, M.G. Weinbauer, and C.A. Suttle [eds.] 2010. Waco, TX:American Society of Limnology and Oceanography. doi:10.4319/mave.2010.978-0-9845591-0-7
- Écologie microbienne : Microbiologie des milieux naturels et anthropisés
Jean-Claude Bertrand, Pierre Caumette, Philippe Lebaron, Robert Matheron, Philippe Normand ; Presses universitaires de Pau et des Pays de l’Adour, 2011
1004 pages, ISBN 2-35311-022-3
PRINCIPALES PUBLICATIONS :
- Viral impact on prokaryotic and microalgal activities in the microphytobenthic biofilm of an intertidal mudflat (French Atlantic coast)
Hélène Montanié , Margot De Crignis , Johann Lavaud Frontiers in microbiology, 2015, 6 : 1214
- Microbial interactions in marine water amended by eroded benthic biofilm : A case study from an intertidal mudflat
Hélène Montanié , Pascaline Ory , Francis Orvain , Daniel Delmas , Dupuy Christine
Journal of Sea Research, Elsevier, 2014, 92 : 74 - 85
- In situ structuring of virioplankton through bacterial exoenzymatic activity : interaction with phytoplankton
Pascaline Ory , Stéphanie Palesse , Daniel Delmas , Hélène Montanié
Aquatic Microbial Ecology, Inter Research, 2011, 64 : 233 - 252.
- Pelagic food web patterns : do they modulate virus and nanoflagellate effects on picoplankton during the phytoplankton spring bloom ?
Pascaline Ory , Hans Hartmann , Florence Jude , Dupuy Christine , Yolanda Del Amo , Philippe Catala , Françoise Mornet , Valérie Huet , Jan Benoit , Dorothée Vincent , Benoit Sautour , Hélène Montanié Environmental Microbiology, Wiley-Blackwell, 2010, 12 (10) : 2755-2772
- Potential effect of freshwater virus on the structure and activity of bacterial communities in the Marennes-Oleron Bay (France).
Auguet JC, Montanié H, Hartmann HJ, Lebaron P, Casamayor EO, Catala P, Delmas D. Microbial Ecology, 2009, 57.2 : 295–306.
- Structure of virioplankton in the Charente Estuary (France) : transmission electron microscopy versus pulsed field gel electrophoresis.
Auguet, J. C., H. Montanie, and P. Lebaron. Microbial Ecology, 2006, 51.2 : 197–208.
- Dynamic of virioplankton abundance and its environmental control in the Charente estuary (France).
Auguet JC, Montanié H, Delmas D, Hartmann HJ, Huet V. Microbial Ecology, 2005, 50.3 : 337–349.