Ory Pascaline

Équipe de rattachement : BIOFEEL
Pascaline.ory01*at*univ-lr.fr
Tél. : +33(O)5 46 50 76 29

Thèse de doctorat 2006/2009
Ecole doctorale de l’Université de La Rochelle
Formation d’origine :
Master Recherche EDEL (Exploitation Durable des Ecosystèmes Littoraux), 2004-2005

(2006/2009) Le réseau trophique microbien : Impact des virus et des protozoaires sur le compartiment bactérien planctonique

Mots clés : Ecologie microbienne, virus, bactéries, nanoflagellés, réseau planctonique, boucle microbienne, lyse virale, prédation
Directeur de thèse : Hélène Montanié, Maître de Conférences, Université de La Rochelle, UMR 7266 LIENSS
Responsables scientifiques : Hélène Montanié, Maître de Conférences, Université de La Rochelle, UMR 7266 LIENSS
Hans J. Hartmann, - Maître de Conférences, Université de La Rochelle, UMR 7266 LIENSS
Financement : Allocation Bourse Docteur-Ingénieur avec co-financement CNRS-Région Poitou-Charentes

Le réseau trophique microbien : Impact des virus et des protozoaires sur le compartiment bactérien planctonique

Longtemps négligés quant à leur implication significative dans les flux trophiques en milieu aquatique, les compartiments microbiens, traduits par leurs fortes abondances et leur ubiquité, représentent pourtant des maillons essentiels dans les transferts de matière. En effet, jusqu’à 50 % de la production primaire pourrait transiter au travers de ces compartiments. Or à l’heure actuelle, le fonctionnement du réseau trophique microbien reste mal connu. Ainsi, dans le but de contribuer à l’amélioration des connaissances du fonctionnement général des écosystèmes aquatiques littoraux, l’objectif de cette étude est de caractériser les interactions existantes entre 3 compartiments microbiens (bactéries, virus et flagellés) dans le bassin de Marennes Oléron selon deux approches, des suivis in situ et des séries d’expérimentations en laboratoire.

Objectifs

Caractériser la dynamique spatio-temporelle du réseau planctonique du bassin de Marennes Oléron par un suivi in situ.
Déterminer la dynamique temporelle des différents types de flux trophiques par un suivi in situ (modèle conceptuel).
Mettre en évidence et caractériser les interactions virus/protozoaires et leurs impacts sur la régulation de la communauté bactérienne en fonction des saisons, de l’état trophique du milieu, de l’apport en nutriment ou de micro-organismes allochtones remis en suspension à partir du biofilm benthique.
Déterminer les effets respectifs des virus, par lyse virale, et des nanoflagellés, par prédation, sur la diversité fonctionnelle des bactéries.

Principales collaborations :
Laboratoire ARAGO, Observatoire de Banyuls, UMR 7621
Laboratoire EPOC, station marine d’Arcachon, Université de Bordeaux 1, UMR 5805

Liste des publications :

8 résultats

2023

Article dans une revue

Metabolomics-Based Investigation on the Metabolic Changes in Crassostrea gigas Experimentally Exposed to Galvanic Anodes

Nathalie Imbert-Auvray , Denis Fichet , Pierre-Edouard Bodet , Pascaline Ory , René Sabot , Philippe Refait , Marianne Graber

Metabolites, 2023, 13 (7), pp.869. ⟨10.3390/metabo13070869⟩

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Communication dans un congrès

Structure et fonctionnement du plancton des marais des Pertuis Charentais et effet de l’aléa submersion sur les fonctions écologiques (épuration, nourricerie).

Lauriane Bergeon , Christine Dupuy , Frédéric Azémar , Bénédicte Dubillot , Marc Bouvy , Claire Carré , Pierre Polsenaere , Jérémy Mayen , Hélène Agogué , Mathieu Paoletti , Philippe Pineau , Claire Emery , Valérie Huet , Thierry Guyot , Pascaline Ory , Emmanuel Dubillot , Nathalie Long , Nicolas Becu , Thomas Lacoue-Labarthe , Marie Vagner , Michèle Tackx

Colloque PAMPAS « Le patrimoine des marais littoraux face aux changements globaux», Projet PAMPAS, 2023, La Rochelle, France

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2022

Article dans une revue

Temporal variations in fecal indicator bacteria in bathing water and sediment in a coastal ecosystem (Aytré Bay, Charente-Maritime, France)

Méry Ndione , Pascaline Ory , Tony Agion , Michaël Treilles , Luc Vacher , Benoit Simon-Bouhet , Maëlig Le Beguec , Philippe Pineau , Hélène Montanié , Hélène Agogué

Marine Pollution Bulletin, 2022, 175, pp.113360. ⟨10.1016/j.marpolbul.2022.113360⟩

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2021

Article dans une revue

Untargeted Metabolomics Reveals a Complex Impact on Different Metabolic Pathways in Scallop Mimachlamys varia (Linnaeus, 1758) after Short-Term Exposure to Copper at Environmental Dose

Vincent Hamani , Pascaline Ory , Pierre-Edouard Bodet , Laurence Murillo , Marianne Graber

Metabolites, 2021, 11 (12), pp.862. ⟨10.3390/metabo11120862⟩

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2014

Article dans une revue

How does the resuspension of the biofilm alter the functioning of the benthos–pelagos coupled food web of a bare mudflat in Marennes-Oléron Bay (NE Atlantic)?

Blanche Saint-Béat , Christine Dupuy , Hélène Agogué , Alexandre Carpentier , Julien Chalumeau , Serena Como , Valérie David , Margot de Crignis , Jean-Claude Duchêne , Camille Fontaine , Eric Feunteun , Katell Guizien , Hans Hartmann , Johann Lavaud , Sébastien Lefebvre , Christel Lefrançois , Clarisse Mallet , Hélène Montanié , Jean-Luc Mouget , Francis Orvain , Pascaline Ory , Pierre-Yves Pascal , Gilles Radenac , Pierre Richard , Nathalie Niquil

Journal of Sea Research (JSR), 2014, 92, pp.144-157. ⟨10.1016/j.seares.2014.02.003⟩

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Microbial interactions in marine water amended by eroded benthic biofilm: A case study from an intertidal mudflat

Hélène Montanié , Pascaline Ory , Francis Orvain , Daniel Delmas , Christine Dupuy

Journal of Sea Research (JSR), 2014, 92, pp.74 - 85. ⟨10.1016/j.seares.2013.11.011⟩

2013

Article dans une revue

Microorganism dynamics in a mudflat during rising tide Microorganism dynamics during a rising tide: Disentangling effects of resuspension and mixing with offshore waters above an intertidal mudflat

Katell Guizien , Christine Dupuy , Pascaline Ory , Hélène Montanié , Hans Hartmann , Mathieu Chatelain , Mikhaïl Karpytchev

Journal of Marine Systems, 2013, ⟨10.1016/j.jmarsys.2013.05.010⟩

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