Activité
Les activités de la plateforme Biologie Moléculaire permettent de mener des travaux dans un secteur de recherche novateur qu’est la génomique environnementale. La génomique environnementale permet de mieux comprendre le fonctionnement des organismes dans leur écosystème, ceci grâce à l’analyse de la séquence des gènes, génomes, transcriptomes. La plateforme Biologie Moléculaire est utilisée pour des activités de recherche fondamentale impliquant des chercheurs du laboratoire LIENSs mais également du CEBC. Elle est également impliquée dans des travaux de recherche appliquée liés à la surveillance des littoraux, en collaboration avec l’observatoire OBIONE et le Port de Plaisance de la Rochelle pour des suivis de biodiversité
Activités de la plateforme de Biologie Moléculaire :
- Développement de marqueurs moléculaires (nucléaires et mitochondriaux) pour des études de génétique et génomique des populations.
- Préparation de banques d’acides nucléiques avant séquençage NGS
- Mise au point de protocoles d’analyses en PCR quantitative pour l’étude de gènes fonctionnels.
- Barcoding moléculaire.
- Étude de la diversité bactérienne et archéenne au sein des écosystèmes littoraux (marais salants, marais doux, vasières, estuaires).
- Caractérisation de la diversité virale au sein des environnements aquatiques.
- Caractérisation fonctionnelle des communautés procaryotes dans les écosystèmes marins (vasières, estuaires).
Poster de présentation de la plateforme Biologie Moléculaire