Ecophysiologie
Le plateau « écophysiologie » fournit au laboratoire LIENSs des outils et des installations pour l’étude des réponses physiologiques et comportementales des organismes des milieux littoraux, à des variables environnementales (température, oxygène, contaminants…). Ce plateau dispose de plusieurs installations d’élevage modulables, pouvant accueillir divers organismes aquatiques (poissons, échinodermes, mollusques bivalves,….), nécessaires aux activités de recherche de l’équipe AMARE.
Il est composé d’une partie Elevage/ Expérimentation animale et d’une partie laboratoire de préparations et d’analyses d’échantillons d’origine animale .
Elevage et expérimentation animale
Le laboratoire dispose de six salles thermostatées permettant de maintenir, d’exposer et de tester des organismes dans des conditions environnementales contrôlées (température, concentrations métalliques, oxygène, dioxyde de carbone, etc.) :
- Deux « salles humides », équipées d’arrivées en eau de mer, oxygène et azote gazeux. Ces salles contiennent actuellement des bassins d’élevage de poissons (mulets, civelles) et de mollusques bivalves (Macoma balthica).
- Une « salle expérimentale » où deux systèmes de régulations de pCO2 (IKS Aquastar®) permettent d’étudier, dans 16 bacs simultanément, de volumes compris entre 500 ml et 50 l, les réponses des organismes dans le contexte de l’acidification des océans.
- Une « salle expérimentale » où des mesures comportementales et physiologiques sont menées sur cette même espèce.
A l’heure actuelle, le plateau dispose de l’agrément français à l’expérimentation et l’utilisation des animaux à des fins scientifiques.
Activités principales
- Étude de la biomécanique, des interactions proies-prédateurs, et du comportement de nage (challenge natatoire, fast-start, réponse de fuite) en environnement variable.
- Étude des performances de nage et de la bio-énergétique en environnement variable.
Équipements principaux
– Caméra haute vitesse
– Tunnels de nage (Figure 1), respiromètres statiques, oxymètres
Responsable : Christel Lefrançois
Laboratoires de préparation et d’analyse
Dans le cadre des recherches de l’équipe AMARE, plusieurs travaux portent sur la réponse des organismes aquatiques, notamment les mollusques bivalves marins, face à divers stress naturels et chimiques (métaux, polluants organiques, perturbateurs endocriniens, nanomatériaux, microplastiques). Ces bioindicateurs sont utilisés pour évaluer la qualité environnementale.
À l’interface entre recherche fondamentale et appliquée, l’approche vise à relier écologie et écotoxicologie via l’étude de biomarqueurs, afin d’extrapoler des réponses biologiques individuelles à des effets à plus large échelle. L’objectif est de contribuer au diagnostic environnemental, en lien avec la Directive européenne sur l’eau, en développant des outils intégrés, rapides et fiables pour évaluer l’impact des polluants sur les écosystèmes littoraux.
Salle de préparation :
Activités principales
- Approches expérimentales réalisées à l’échelle de la cellule sur différentes fonctions et systèmes biologiques clés (la fonction cardiaque, le système immunitaire).
Exemples :
- Caractérisations fonctionnelle et ultrastructurale des mécanismes du Couplage Excitation-Contraction (CEC) de la fonction cardiaque.
- Mise au point de marquages/immunomarquages pour l’observation de structures intracellulaires de divers modèles biologiques (poissons (figures 2 et 3), bivalves).
- Analyses iso/ratiométriques de cellules cardiaques chez le poisson (sole, bar, mulet, killifish) permettant ainsi de mesurer les flux et la concentration calciques intracellulaires.
Figure 2. Cardiomyocyte (Gx1000) de N. furzeri (36 semaines, 26 °C) marqué au DAPI (bleu) et phalloïdine (vert), mettant en évidence le noyau et les fibres d’actine.
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Figure 3. Cardiomyocyte (Gx1000) de N. furzeri (37 semaines, 26 °C) marqué au di-8-Anepps (vert), mettant en évidence la membrane plasmique.
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- Suivi de différentes activités intracellulaires (ex : viabilité, apoptose, activité enzymatique estérase, stress oxydant) suite à des modifications environnementales (polluants, température) sur cardiomyocytes de poissons, hémocytes de bivalves, ou gamètes d’oursins.
- Par sa position en contact étroit avec le milieu environnant, l’épithélium branchial des poissons téléostéens constitue l’une des principales voies d’entrée des contaminants aquatiques. Dans ce cadre nous nous intéressons aux répercussions de ces contaminations sur la communication jonctionnelle d’une lignée cellulaire de branchie de truite arc-en-ciel.
Équipements associés
– Sorbonne
– Balances de précisions
– pH-mètre
– Agitateurs, Vortex
– Bain marie
– Incubateur
– Centrifugeuses réfrigérées
– Sonicateur
– Réfrigérateurs, congélateurs
- Osmomètre cryoscopique
– Broyeurs, disperseurs
– Micropipettes
– 1 Système de mesure de la contraction sur organe isolé
– 1 Lecteur de microplaques
Responsables :
Référente technique :
Salle d’Electrophysiologie : Station imagerie/Patch clamp
Équipements principaux
- Microscope inversé automatisé DMI 6000 B, Leica Microsystems CMS, équipé d’un boitier oligochrome TILL Photonics GmbH avec jeu de filtres à fluorescence. (financements obtenus dans le cadre du Contrat de Projet Etat-Région 2007-2013, et d’un projet FEDER Poitou-Charentes)
Équipements associés
– Caméra Hamamatsu sur table antivibratoire
– Platine thermostatée
– Etireuse
Salle d’oxygraphie
Équipements principaux
– 2 oxygraphes haute résolution Oroboros O2k FluoRespirometer
Salle de culture cellulaire
Équipements associés
– PSM JOUAN
– Etuve à CO2 JOUAN
– Microscope