présentation
Equipes : DYFEA, MAB et BIEN
Mots clé :
vasière intertidale- exopolysaccharides- diversité bactérienne- adhésion - quorum-sensing -structuration
Objectifs :
1/ Caractériser la diversité structurale des espèces procaryotes présentes dans le biofilm des vasières intertidales, d’une part par isolement, caractérisation biochimique et phylogénie d’espèces cultivables (bactéries chimiohétérotrophes) et d’autre part par la réalisation d’empreintes génétiques (TTGE) du métagénome bactérien et archéen (ADNr16S) du biofilm benthique, avec identification des espèces dominantes.
2/ Etudier le déterminisme moléculaire de la structuration du biofilm par (i) la caractérisation des exopolysaccharides (EPS), par (ii) l’étude des propriétés des surfaces des EPS des diatomées et des bactéries isolées, par (iii) la mise en évidence de molécules impliquées dans la communication cellulaire micro-algale et bactérienne et par (iv) l’étude de la diversité fonctionnelle des procaryotes (gènes métaboliques).