LIttoral ENvironnement et Sociétés (LIENSs) - UMR 7266

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Arnaudin (Fruitier) Ingrid

Enseignant-chercheur , Professeur des universités
Université de La Rochelle
Section de Recherche : CNU 64
Département scientifique CNRS : INEE (principal), INC (rattachement secondaire)

Mots clés : peptides et oligosaccharides thérapeutiques, actifs algosourcés, ciblage de protéases et de glycosidases humaines et bactériennes, dysfonctionnements moléculaires et cellulaires, outils du diagnostic

  • Co-animatrice de l’axe 1 " Substances naturelles à visée anti-cancéreuse » de l’équipe BCBS et référente du réseau de recherche « Oncosphère » de Nouvelle-Aquitaine pour le site Rochelais
  • Titulaire de la Chaire de Biotechnologies Bioaqtiv (2016-2019)
  • Membre élu de la section 64 du CNU, Collège B (2016-2019)
  • Réfèrente de la filière Biotechnologies-agroalimentaire-santé auprès de La Rochelle Université
  • Directrice des études de la Licence mention Sciences pour la Santé de La Rochelle Université
  • Référente scientifique du Comité de Coordination des Experts Scientifiques de la Région Nouvelle-Aquitaine (en charge du thème 3 « Biologie-santé, 2022-2026)
  • Membre du Conseil d’Administration du comité de Charente-Maritime de la Ligue Contre le Cancer
  • Membre du conseil scientifique du comité de la Haute-Vienne de la Ligue Contre le Cancer (depuis 2023)
Production scientifique
  • 50 publications de rang A : lien ORCID
  • Co-inventrice de 5 brevets
  • 10 conférences avec actes, plus de 30 communications internationales
  • 1 chapitre de livre
Encadrement doctoral, post-doctoral et autres
  • Direction et co-direction de 13 thèses (10 soutenues et 3 en cours)
  • Encadrement post-doctoraux : Hugo Groult (contractuel CNRS- 2016-2020) sur le projet d’utilisation de l’héparanase comme outil biologique pour la vectorisation de sondes dans des applications thérapeutiques et diagnostiques ; Julien Cherfan (contractuel CNRS 2020-2021) sur le projet NEURONALG de développement d’actifs algosourcés pour la prise en charge de troubles cognitifs liés au diabète de type 2 ; Jennifer Saliba (contractuel CNRS 2023-2024) sur le projet MOLNAT de développement de molécules naturelles pharmacomodulatrices de cibles en cancérologie.
  • Supervision scientifique de Jonathan Izambart (Assistant-ingénieur, contractuel ADERA 2023-2024) sur le projet France RELANCE ALG4Ré visant à accompagne l’implantation d’un laboratoire in situ de culture de macroalgues endémiques de Ré.
  • Encadrement de plus de 30 étudiants de master2 ou d’élèves ingénieurs
Thèses en cours :
  • Chanez Manseur (en cours 2020-2023) « Conception et optimisation d’oligosaccharides marins sulfatés pharmacomodulateurs de la progression tumorale » Co-direction : 50% I. Arnaudin 50% et T. Maugard  ; encadrement scientifique par Hugo Groult
  • Manon Porta en cours (2021-2024) Utilisation d’oligosaccharides marins en nanomédecine contre le cancer Co-direction : 50% I. Arnaudin 50% H. Groult
  • Clément Daviaud en cours (2021-2024) Compréhension du rôle du couple héparanases 1 et 2 dans les processus inflammatoires : développement de stratégies thérapeutiques innovantes à base d’oligosaccharides marins Co-direction : 70% K. Baranger 30% I. Arnaudin
Thèse récentes soutenues :
  • Rémi Cousin (en cours 2017-2021 ) « Développement de modèles cellulaires et d’outils moléculaires dédiés au suivi de l’inhibition ciblée de l’héparanase, une glycosidase impliquée dans les processus métastatiques et angiogéniques ». Direction : 50% T. Maugard et 50% I. Arnaudin
  • Claire Toucheteau ‘’Criblage, identification et mise en œuvre d’exopolysaccharides de microalgues comme agents biologiques et hydrocolloïdes’’.25 mai 2020, co-direction avec T.Maugard T (allocation CNRS - ANR POLYSALGUE).
  • Nicolas Poupard "Conception de polysaccharides sulfatés inhibiteurs de l’héparanase pour le traitement de l’angiogenèse tumorale", 30 Juin 2017, co-direction avec T. Maugard
  • Meriem Laamari « Approches moléculaires des effets de toxines marines et de micropolluants sur modèles cellulaires », 16 Décembre 2016, co-direction avec S. Bordenave
  • Rachida Mersni-Achour « Hydrolases bactériennes marines », direction, soutenance 2014
  • Oussama Achour « Ciblage d’hydrolases tumorales », co-direction avec T. Maugard, soutenance 2014

 

Thèmes de Recherche :
  • Etudes et validations de nouvelles cibles biologiques en cancérologie. Développement d’actifs pharmacologiques de base polysaccharidique et peptidique à partir de biomasses algales par des approches de Biochimie, de biologie cellulaire et d’ingénierie moléculaire.
  • Etude des rôles de glycosyl hydrolases (héparanase) et de protéases impliquées dans la progression tumorale
  • Conception de mimétiques de glycosaminoglycannes ciblant l’activité hydrolytique de l’héparanase

Mes travaux de recherche en Biochimie et en Ingénierie moléculaire se déclinent en plusieurs projets, tous liés à des encadrements doctoraux ou post-doctoraux. Les résultats de ces projets me permettent de concevoir différentes stratégies de ciblage d’enzymes hydrolytiques appliquées au diagnostique et/ou à la thérapeutique de pathologies humaines. Au cours de ces travaux, 1) je teste la fonction inhibitrice de mimétiques de glycosaminoglycanes. Ces actifs sont soit extraits de ressources biologiques naturelles (algues ou bactéries marines) soit conçus par voies chimiques, 2) j’étudie les mécanismes moléculaires influençant les propriétés d’invasion, de migration et d’angiogenèse de cellules modèles traitées par les actifs produits. Cela me permet de 1) manipuler les outils classiques de culture cellulaire, de biologie cellulaire et moléculaire, 2) de tester des interactions moléculaires enzyme-substrats-inhibiteurs 3) de mener des analyses protéomiques des systèmes enzymatiques et de leurs effets (1D, 2D, zymographies, blot), des dosages enzymatiques sur enzymes isolées ou à partir de milieux cellulaires complexes hétérogènes, des dosages ELISA et 4) d’utiliser tous les outils analytiques de caractérisation structurale des actifs produits (LC et LC/MS).

Cette expertise me conduit également à développer des projets de recherche « satellites » en lien avec la problématique « environnement-santé » de mon unité en me permettant de m’intéresser à des questions d’impact de l’environnement moléculaire sur le vivant. Notamment, en combinant les technologies protéomiques, enzymologiques et de chimie analytique, je peux répondre à la question des mécanismes moléculaires sous-jacents des effets toxiques de contaminants environnementaux de populations exposées à la fois humaines et animales.

  • Interview réalisée à Poitiers le 27/03/2018 (disponible sur youtube)

Liste des publications :